Publications

Epidemiology and Demography

Malaria infection and severe disease risks in Africa.Paton, R. S. Kamau, A. Akech, S. Agweyu, A. Ogero, M. Mwandawiro, C. Mturi, N. Mohammed, S. Mpimbaza, A. Kariuki, S. Otieno, N. A. Nyawanda, B. O. Mohamed, A. F. Mtove, G. Reyburn, H. Gupta, S. Bejon, P. Lourenco, J. Snow, R. W.
Science, (2021). 373:926-931

Tracking the introduction and spread of SARS-CoV-2 in coastal Kenya.Githinji, G. de Laurent, Z. R. Mohammed, K. S. Omuoyo, D. O. Macharia, P. M. Morobe, J. M. Otieno, E. Kinyanjui, S. M. Agweyu, A. Maitha, E. Kitole, B. Suleiman, T. Mwakinangu, M. Nyambu, J. Otieno, J. Salim, B. Kasera, K. Kiiru, J. Aman, R. Barasa, E. Warimwe, G. Bejon, P. Tsofa, B. Ochola-Oyier, L. I. Nokes, D. J. Agoti, C. N.
Nat Commun, (2021). 12:4809

Incidence and predictors of hospital readmission in children presenting with severe anaemia in Uganda and Malawi: a secondary analysis of TRACT trial data.Connon, R. George, E. C. Olupot-Olupot, P. Kiguli, S. Chagaluka, G. Alaroker, F. Opoka, R. O. Mpoya, A. Walsh, K. Engoru, C. Nteziyaremye, J. Mallewa, M. Kennedy, N. Nakuya, M. Namayanja, C. Nabawanuka, E. Sennyondo, T. Amorut, D. Williams Musika, C. Bates, I. Boele van Hensbroek, M. Evans, J. A. Uyoga, S. Williams, T. N. Frost, G. Gibb, D. M. Maitland, K. Walker, A. S. Tract trial group
BMC Public Health, (2021). 21:1480

Revitalizing child health: lessons from the past.Strong, K. L. Requejo, J. Agweyu, A. Billah, S. M. Boschi-Pinto, C. Horiuchi, S. Jamaluddine, Z. Lazzerini, M. Maiga, A. McKerrow, N. Munos, M. Schellenberg, J. Weigel, R.
Glob Health Action, (2021). 14:1947565

Gastroenteritis Rehydration Of children with Severe Acute Malnutrition (GASTROSAM): A Phase II Randomised Controlled trial: Trial Protocol.Olupot-Olupot, P. Aloroker, F. Mpoya, A. Mnjalla, H. Paasi, G. Nakuya, M. Houston, K. Obonyo, N. Hamaluba, M. Evans, J. A. Dewez, M. Atti, S. Guindo, O. Ouattara, S. M. Chara, A. Sainna, H. A. Amos, O. O. Ogundipe, O. Sunyoto, T. Coldiron, M. Langendorf, C. Scherrer, M. F. Petrucci, R. Connon, R. George, E. C. Gibb, D. M. Maitland, K.
Wellcome Open Res, (2021). 6:160

Spatially resolved simulations of the spread of COVID-19 in three European countries.Parisi, A. Brand, S. P. C. Hilton, J. Aziza, R. Keeling, M. J. Nokes, D. J.
PLoS Comput Biol, (2021). 17:e1009090

Improving statistical power in severe malaria genetic association studies by augmenting phenotypic precision.Watson, J. A. Ndila, C. M. Uyoga, S. Macharia, A. Nyutu, G. Mohammed, S. Ngetsa, C. Mturi, N. Peshu, N. Tsofa, B. Rockett, K. Leopold, S. Kingston, H. George, E. C. Maitland, K. Day, N. P. Dondorp, A. M. Bejon, P. Williams, T. N. Holmes, C. C. White, N. J.
Elife, (2021). 10:

Temporal trends of SARS-CoV-2 seroprevalence during the first wave of the COVID-19 epidemic in Kenya.Adetifa, I. M. O. Uyoga, S. Gitonga, J. N. Mugo, D. Otiende, M. Nyagwange, J. Karanja, H. K. Tuju, J. Wanjiku, P. Aman, R. Mwangangi, M. Amoth, P. Kasera, K. Ng'ang'a, W. Rombo, C. Yegon, C. Kithi, K. Odhiambo, E. Rotich, T. Orgut, I. Kihara, S. Bottomley, C. Kagucia, E. W. Gallagher, K. E. Etyang, A. Voller, S. Lambe, T. Wright, D. Barasa, E. Tsofa, B. Bejon, P. Ochola-Oyier, L. I. Agweyu, A. Scott, J. A. G. Warimwe, G. M.
Nat Commun, (2021). 12:3966

The Plasmodium falciparum Rh5 invasion protein complex reveals an excess of rare variant mutations.Ndwiga, L. Osoti, V. Ochwedo, K. O. Wamae, K. Bejon, P. Rayner, J. C. Githinji, G. Ochola-Oyier, L. I.
Malar J, (2021). 20:278

Prevalence and fluid management of dehydration in children without diarrhoea admitted to Kenyan hospitals: a multisite observational study.Omoke, S. English, M. Aluvaala, J. Gathara, D. Agweyu, A. Akech, S. Clinical Information, Network
BMJ Open, (2021). 11:e042079

Modifying gut integrity and microbiome in children with severe acute malnutrition using legume-based feeds (MIMBLE): A pilot trial.Calder, N. Walsh, K. Olupot-Olupot, P. Ssenyondo, T. Muhindo, R. Mpoya, A. Brignardello, J. Wang, X. McKay, E. Morrison, D. Holmes, E. Frost, G. Maitland, K.
Cell Rep Med, (2021). 2:100280

Nocturnal dipping of heart rate and blood pressure in people with HIV in Tanzania.Nolan, C. Reis, K. Fadhil, S. Etyang, A. Ezeomah, C. Kingery, J. R. Desderius, B. Lee, M. H. Kapiga, S. Peck, R. N.
J Clin Hypertens (Greenwich), (2021). 23:1452-1456

Neonatal mortality in Kenyan hospitals: a multisite, retrospective, cohort study.Irimu, G. Aluvaala, J. Malla, L. Omoke, S. Ogero, M. Mbevi, G. Waiyego, M. Mwangi, C. Were, F. Gathara, D. Agweyu, A. Akech, S. English, M. Clinical Information Network, authors
BMJ Glob Health, (2021). 6:

Comparative analysis of spatial-temporal patterns of human metapneumovirus and respiratory syncytial virus in Africa using genetic data, 2011-2014.Oketch, J. W. Kamau, E. Otieno, J. R. Mwema, A. Lewa, C. Isoe, E. Nokes, D. J. Agoti, C. N.
Virol J, (2021). 18:104

Proposal for Human Respiratory Syncytial Virus Nomenclature below the Species Level.Salimi, V. Viegas, M. Trento, A. Agoti, C. N. Anderson, L. J. Avadhanula, V. Bahl, J. Bont, L. Brister, J. R. Cane, P. A. Galiano, M. Graham, B. S. Hatcher, E. L. Hellferscee, O. Henke, D. M. Hirve, S. Jackson, S. Keyaerts, E. Kragten-Tabatabaie, L. Lindstrom, S. Nauwelaers, I. Nokes, D. J. Openshaw, P. J. Peret, T. C. Piedra, P. A. Ramaekers, K. Rector, A. Trovao, N. S. von Gottberg, A. Zambon, M. Zhang, W. Williams, T. C. Barr, I. G. Buchholz, U. J.
Emerg Infect Dis, (2021). 27:1-9

Prevalence and predictors of vitamin D deficiency in young African children.Mogire, R. M. Morovat, A. Muriuki, J. M. Mentzer, A. J. Webb, E. L. Kimita, W. Ndungu, F. M. Macharia, A. W. Cutland, C. L. Sirima, S. B. Diarra, A. Tiono, A. B. Lule, S. A. Madhi, S. A. Sandhu, M. S. Prentice, A. M. Bejon, P. Pettifor, J. M. Elliott, A. M. Adeyemo, A. Williams, T. N. Atkinson, S. H.
BMC Med, (2021). 19:115

Prevalence and mortality of epilepsies with convulsive and non-convulsive seizures in Kilifi, Kenya.Kariuki, S. M. Ngugi, A. K. Kombe, M. Z. Kazungu, M. Chengo, E. Odhiambo, R. Nyaguara, A. Neville, B. G. Newton, C. R.
Seizure, (2021). 89:51-55

Point-of-care haemoglobin testing in African hospitals: a neglected essential diagnostic test.Uyoga, S. George, E. C. Bates, I. Olupot-Olupot, P. Chimalizeni, Y. Molyneux, E. M. Maitland, K.
Br J Haematol, (2021). 193:894-901

Transfusion management of severe anaemia in African children: a consensus algorithm.Maitland, K. Kiguli, S. Olupot-Olupot, P. Opoka, R. O. Chimalizeni, Y. Alaroker, F. Uyoga, S. Kyeyune-Byabazaire, D. M'Baya, B. Bates, I. Williams, T. N. Munube, D. Mbanya, D. Molyneux, E. M. South, A. Walker, A. S. Gibb, D. M. George, E. C. Tract Stakeholders meeting group
Br J Haematol, (2021). 193:1247-1259

Randomised controlled trial of oxygen therapy and high-flow nasal therapy in African children with pneumonia.Maitland, K. Kiguli, S. Olupot-Olupot, P. Hamaluba, M. Thomas, K. Alaroker, F. Opoka, R. O. Tagoola, A. Bandika, V. Mpoya, A. Mnjella, H. Nabawanuka, E. Okiror, W. Nakuya, M. Aromut, D. Engoru, C. Oguda, E. Williams, T. N. Fraser, J. F. Harrison, D. A. Rowan, K. Coast trial group
Intensive Care Med, (2021). 47:566-576