Publications

Epidemiology and Demography

The Epidemiology of Sickle Cell Disease in Sub-Saharan Africa: Current Knowledge and Gaps to be Filled.Ranque, B. Tshilolo, L. Williams, T. N.
Am J Hematol, (2026). 101 Suppl 1:5-16

Oral rehydration for severe malnutrition in children with moderate and severe dehydration (GASTROSAM): a phase 2, open-label, superiority randomised controlled trial.Maitland, K. Sainna, H. Connon, R. Ouattara, S. M. Sunyoto, T. Chara, A. Ogundipe, O. F. Maguina, A. S. Hamaluba, M. Olupot-Olupot, P. Alaroker, F. Okiror, W. Aromut, D. Mwajombo, E. Oguda, E. Mogaka, C. Langendorf, C. Dewez, J. E. Ciglenecki, I. Gibb, D. M. Petrucci, R. Coldiron, M. E. George, E. C. Gastrosam trial group
Lancet Child Adolesc Health, (2026). 10:319-329

Prevalence, spatial and temporal distribution of tungiasis in the Kilifi Health and Demographic Surveillance System (KHDSS) in Kenya.Ouma, N. Muchiri, S. K. Nyundo, C. Walumbe, D. Nyaguara, A. Maia, M. Adetifa, I. Orindi, B. Bejon, P. Fillinger, U. Elson, L.
BMJ Glob Health, (2026). 11:

Nasopharyngeal Microbiome Composition and its Clinical Correlates in Children Hospitalized with Severe Pneumonia in East Africa.Makori, T. O. Gicheru, E. T. Mburu, M. W. Sada, M. S. Nyawa, O. Mutunga, M. Lewa, C. Cheruiyot, R. Kiguli, S. Olupot-Olupot, P. Muhindo, R. Mogaka, C. Williams, T. N. Agoti, C. N. Maitland, K. Sande, C. J.
J Infect Dis, (2026). :

Serotype-specific pneumococcal invasiveness: a global meta-analysis of paired estimates of disease incidence and carriage prevalence.Gallagher, K. E. Odiwour, F. Bottomley, C. Ojal, J. Adamu, A. Muthumbi, E. Kagucia, E. W. Hammitt, L. L. Massora, S. Sigauque, B. Chauque, A. Vilanculos, L. Verani, J. R. da Gloria Carvalho, M. von Gottberg, A. Kleynhans, J. Madhi, S. A. Olwagen, C. P. Mackenzie, G. Salaudeen, R. Gierke, R. Kobayashi, M. Pelton, S. Yildirim, I. Thomas, S. Tunali, A. Farley, M. Swarthout, T. D. Kalizang'oma, A. Heyderman, R. S. French, N. Choi, Y. Andrews, N. Ladhani, S. Miller, E. Scott, J. A. G.
Lancet Microbe, (2026). 7:101301

Understanding what factors influence community health worker involvement in hypertension service delivery in Kenya: applying a community health system lens.Kagwanja, N. Oyando, R. Hassan, S. Diallo, B. A. Badjie, J. Lucinde, R. Mumba, N. Kinyanjui, S. Perel, P. Etyang, A. Aaliyan, N. Leli, H. Nolte, E. Tsofa, B.
Health Policy Plan, (2026). 41:627-639

Understanding the role of 'software' in health system capacity for non-communicable disease response: hypertension care in rural Coastal Kenya.Oyando, R. Kagwanja, N. Diallo, B. A. Hassan, S. Badjie, J. Lucinde, R. Mumba, N. Kinyanjui, S. M. Perel, P. Etyang, A. Barasa, E. Nolte, E. Tsofa, B.
Health Policy Plan, (2026). 41:584-598

Gut microbial diversity impacts carbohydrate fermentation by children with severe acute malnutrition.Bisht, A. Ahn-Jarvis, J. Corbin, K. Harris, S. Troncoso-Rey, P. Olupot-Olupot, P. Calder, N. Walsh, K. Maitland, K. Frost, G. Warren, F. J.
iScience, (2026). 29:114640

Seroprevalence of antibodies against diphtheria, tetanus, and pertussis over a 12-year period in children in Kilifi, Kenya (2009-2021).Mburu, C. N. Ojal, J. Selim, R. Ombati, R. Akech, D. Karia, B. Tuju, J. Sigilai, A. Smits, G. van Gageldonk, P. G. M. van der Klis, F. R. M. Flasche, S. Kagucia, E. W. Scott, J. Adetifa, I.
Int J Infect Dis, (2026). 164:108396

A cost-consequence analysis of the children's administration oxygenation strategies trial (COAST) in severe pneumonia.Carroll, O. U. Grieve, R. Kiguli, S. Olupot-Olupot, P. Opoka, R. O. Alaroker, F. Tagoola, A. Hamaluba, M. Nabawanuka, E. Nalwanga, D. Williams, T. N. Thomas, K. Harrison, D. A. Mouncey, P. Giallongo, E. Rowan, K. Maitland, K. Sadique, Z.
PLOS Glob Public Health, (2026). 6:e0005654

Hydroxyurea pharmacokinetics in children with sickle cell anemia across different global populations.Power-Hays, A. McElhinney, K. E. Williams, T. N. Mochamah, G. Olupot-Olupot, P. Paasi, G. Reid, M. E. Rankine-Mullings, A. E. Opoka, R. O. John, C. C. McGann, P. T. Quinn, C. T. Punt, N. C. Smart, L. R. Stuber, S. E. Latham, T. S. Vinks, A. A. Ware, R. E.
Blood Adv, (2026). 10:418-427

Access to hypertension services and health-seeking experiences in rural Coastal Kenya: A qualitative study.Oyando, R. Kagwanja, N. Diallo, B. A. Hassan, S. Badjie, J. Lucinde, R. Mumba, N. Kinyanjui, S. M. Perel, P. Etyang, A. Barasa, E. Nolte, E. Tsofa, B. I. HCoR-Africa Collaborators
PLOS Glob Public Health, (2025). 5:e0004324

Active vaccine safety surveillance: Experience from a prospective cohort event monitoring study of COVID-19 vaccines in Kenya.Odhiambo, D. B. Akech, D. Karia, B. Kimani, M. Sang, S. Sigilai, A. Voller, S. Mataza, C. Mang'ong'o, D. Jalang'o, R. Mandale, M. Etyang, A. O. Scott, J. A. G. Agweyu, A. Kagucia, E. W.
PLOS Glob Public Health, (2025). 5:e0005080

Coxsackievirus A24 variant whole genome sequencing from clinical samples using a three overlapping amplicons strategy.Morobe, J. M. Odoyo, S. Lambisia, A. W. Moraa, E. Houldcroft, C. J. Holmes, E. C. Githinji, G. Agoti, C. N.
Wellcome Open Res, (2025). 10:316

A Pragmatic Trial of Glucocorticoids for Community-Acquired Pneumonia.Lucinde, R. K. Gathuri, H. Mwaniki, P. Orindi, B. Otieno, E. O. Mwakio, S. Mulemi, L. Isaaka, L. Shangala, J. Saisi, M. Isinde, E. Oginga, I. N. Wachira, A. W. Manuthu, E. Kariuki, H. Asaava, P. Nyikuli, J. Wekesa, C. Otedo, A. Bosire, H. Okoth, S. B. Ongalo, W. Mukabi, D. M. Lusamba, W. Muthui, B. Adembesa, I. Mithi, C. Sood, M. Aliyan, N. A. Gituma, B. Matiko, M. G. Omondi, C. A. Ombajo, L. A. Kirui, N. Ochola, L. Abdi, A. I. Kagucia, E. W. English, M. Hamaluba, M. Ochola-Oyier, I. Kamuya, D. Bejon, P. Barasa, E. Agweyu, A. Akech, S. Etyang, A. O.
N Engl J Med, (2025). 393:2187-2197

Plasma folate dynamics in Plasmodium falciparum-infected African children treated with artemisinin combination therapy and single low-dose primaquine or placebo.Ajayi, S. Onyamboko, M. A. Olupot-Olupot, P. Ayuen, D. S. Chimjinda, N. Taya, C. Williams, T. N. Uyoga, S. Maitland, K. Fanello, C. Day, N. P. J. Mukaka, M. Taylor, W. R. J.
Malar J, (2025). 24:342

Assessing the Impact of SARS-CoV-2 Spike Mutations on Antibody Binding: A Comparative Assessment of the Wuhan and JN.1 Variants' Full-Length Spikes in a Multiplex Luminex Assay.Waweru, G. Nyakundi, R. Kutima, B. Owuor, S. Konyino, G. Gitonga, J. Lugano, D. Maina, A. Musyoki, J. Ochola, L. Omondi, M. Kariuki, C. K. Ogongo, P. Mwachari, C. Shee, F. Agoti, C. Sande, C. Uyoga, S. Kagucia, E. Agweyu, A. Bejon, P. Scott, J. A. G. Warimwe, G. M. Ochola-Oyier, L. I. Nyagwange, J.
Viruses, (2025). 17:

Modelling the relative contribution of infection, routine vaccination and supplementary immunisation activities to measles seroconversion in Kenyan Children.Mburu, C. Ojal, J. Selim, R. Ombati, R. Akech, D. Karia, B. Tuju, J. Sigilai, A. Smits, G. Gageldonk, P. V. Klis, F. V. Kagucia, E. Scott, A. Adetifa, I. Flasche, S.
PLoS Comput Biol, (2025). 21:e1013531

Genomic and clinical epidemiology of SARS-CoV-2 in coastal Kenya: insights into variant circulation, reinfection, and multiple lineage importations during a post-pandemic wave.Lambisia, A. W. Katama, E. N. Moraa, E. Mwita, J. M. Gallagher, K. Mutunga, M. Nyale, E. Omungala, J. Mwanga, M. Murunga, N. Nyiro, J. Nyagwange, J. Sande, C. Bejon, P. Githinji, G. Dellicour, S. Phan, M. V. T. Cotten, M. Ochola-Oyier, L. I. Holmes, E. C. Agoti, C. N.
BMC Glob Public Health, (2025). 3:80

Cryptosporidium parvum virus 1 genome sequences from pediatric diarrhea cases in coastal Kenya.Agoti, C. N. Njeru, R. Mwanga, M. Mutunga, M. Shah, S. P. Chu, T. Y. Nokes, D. J. Cotten, M. Phan, M. V. T.
Microbiol Resour Announc, (2025). 14:e0034925