Publications

Epidemiology and Demography

Accuracy of diagnostic tests for respiratory syncytial virus infection within a paediatric hospital population in Kilifi County, Kenya.Mweu, M. M. Murunga, N. Otieno, J. W. Nokes, D. J.
Wellcome Open Res, (2020). 5:155

How Severe Anaemia Might Influence the Risk of Invasive Bacterial Infections in African Children.Abuga, K. M. Muriuki, J. M. Williams, T. N. Atkinson, S. H.
Int J Mol Sci, (2020). 21:

Red blood cell tension protects against severe malaria in the Dantu blood group.Kariuki, S. N. Marin-Menendez, A. Introini, V. Ravenhill, B. J. Lin, Y. C. Macharia, A. Makale, J. Tendwa, M. Nyamu, W. Kotar, J. Carrasquilla, M. Rowe, J. A. Rockett, K. Kwiatkowski, D. Weekes, M. P. Cicuta, P. Williams, T. N. Rayner, J. C.
Nature, (2020). 585:579-583

Genomic epidemiology and evolutionary dynamics of respiratory syncytial virus group B in Kilifi, Kenya, 2015-17.Kamau, E. Otieno, J. R. Murunga, N. Oketch, J. W. Ngoi, J. M. de Laurent, Z. R. Mwema, A. Nyiro, J. U. Agoti, C. N. Nokes, D. J.
Virus Evol, (2020). 6:veaa050

The clinical spectrum of severe childhood malaria in Eastern Uganda.Olupot-Olupot, P. Engoru, C. Nteziyaremye, J. Chebet, M. Ssenyondo, T. Muhindo, R. Nyutu, G. Macharia, A. W. Uyoga, S. Ndila, C. M. Karamagi, C. Maitland, K. Williams, T. N.
Malar J, (2020). 19:322

Characterising demographics, knowledge, practices and clinical care among patients attending sickle cell disease clinics in Eastern Uganda.Olupot-Olupot, P. Wabwire, H. Ndila, C. Adong, R. Ochen, L. Amorut, D. Abongo, G. Okalebo, C. B. Akello, S. R. Oketcho, J. B. Okiror, W. Asio, S. Odiit, A. Alaroker, F. Nyutu, G. Maitland, K. Williams, T. N.
Wellcome Open Res, (2020). 5:87

Methodological rigor of prognostic models for predicting in-hospital paediatric mortality in low- and middle-income countries: a systematic review protocol.Ogero, M. Sarguta, R. Malla, L. Aluvaala, J. Agweyu, A. Akech, S.
Wellcome Open Res, (2020). 5:106

Factors influencing the implementation of cardiovascular risk scoring in primary care: a mixed-method systematic review.Muthee, T. B. Kimathi, D. Richards, G. C. Etyang, A. Nunan, D. Williams, V. Heneghan, C.
Implement Sci, (2020). 15:57

Rotavirus group A genotype circulation patterns across Kenya before and after nationwide vaccine introduction, 2010-2018.Mwanga, M. J. Owor, B. E. Ochieng, J. B. Ngama, M. H. Ogwel, B. Onyango, C. Juma, J. Njeru, R. Gicheru, E. Otieno, G. P. Khagayi, S. Agoti, C. N. Bigogo, G. M. Omore, R. Addo, O. Y. Mapaseka, S. Tate, J. E. Parashar, U. D. Hunsperger, E. Verani, J. R. Breiman, R. F. Nokes, D. J.
BMC Infect Dis, (2020). 20:504

The need for COVID-19 research in low- and middle-income countries.Gupta, M. Wahl, B. Adhikari, B. Bar-Zeev, N. Bhandari, S. Coria, A. Erchick, D. J. Gupta, N. Hariyani, S. Kagucia, E. W. Killewo, J. Limaye, R. J. McCollum, E. D. Pandey, R. Pomat, W. S. Rao, K. D. Santosham, M. Sauer, M. Wanyenze, R. K. Peters, D. H.
Glob Health Res Policy, (2020). 5:33

Upper airways colonisation of Streptococcus pneumoniae in adults aged 60 years and older: A systematic review of prevalence and individual participant data meta-analysis of risk factors.Smith, E. L. Wheeler, I. Adler, H. Ferreira, D. M. Sa-Leao, R. Abdullahi, O. Adetifa, I. Becker-Dreps, S. Esposito, S. Farida, H. Kandasamy, R. Mackenzie, G. A. Nuorti, J. P. Nzenze, S. Madhi, S. A. Ortega, O. Roca, A. Safari, D. Schaumburg, F. Usuf, E. Sanders, E. A. M. Grant, L. R. Hammitt, L. L. O'Brien, K. L. Gounder, P. Bruden, D. J. T. Stanton, M. C. Rylance, J.
J Infect, (2020). 81:540-548

Is the effect of COVID-19 on children underestimated in low- and middle- income countries?.Simba, J. Sinha, I. Mburugu, P. Agweyu, A. Emadau, C. Akech, S. Kithuci, R. Oyiengo, L. English, M.
Acta Paediatr, (2020). 109:1930-1931

Malaria infection, disease and mortality among children and adults on the coast of Kenya.Kamau, A. Mtanje, G. Mataza, C. Mwambingu, G. Mturi, N. Mohammed, S. Ong'ayo, G. Nyutu, G. Nyaguara, A. Bejon, P. Snow, R. W.
Malar J, (2020). 19:210

Risk of pneumococcal bacteremia in Kenyan children with glucose-6-phosphate dehydrogenase deficiency.Gilchrist, J. J. Uyoga, S. Pirinen, M. Rautanen, A. Mwarumba, S. Njuguna, P. Mturi, N. Kenyan Bacteraemia Study, Group Hill, A. V. S. Scott, J. A. G. Williams, T. N.
BMC Med, (2020). 18:148

Transmission and evolutionary dynamics of human coronavirus OC43 strains in coastal Kenya investigated by partial spike sequence analysis, 2015-16.Abidha, C. A. Nyiro, J. Kamau, E. Abdullahi, O. Nokes, D. J. Agoti, C. N.
Virus Evol, (2020). 6:veaa031

Vitamin D Status Is Not Associated with Cognitive or Motor Function in Pre-School Ugandan Children.Mutua, A. M. Nampijja, M. Elliott, A. M. Pettifor, J. M. Williams, T. N. Abubakar, A. Webb, E. L. Atkinson, S. H.
Nutrients, (2020). 12:

Protecting children in low-income and middle-income countries from COVID-19.Ahmed, S. Mvalo, T. Akech, S. Agweyu, A. Baker, K. Bar-Zeev, N. Campbell, H. Checkley, W. Chisti, M. J. Colbourn, T. Cunningham, S. Duke, T. English, M. Falade, A. G. Fancourt, N. S. Ginsburg, A. S. Graham, H. R. Gray, D. M. Gupta, M. Hammitt, L. Hesseling, A. C. Hooli, S. Johnson, A. B. King, C. Kirby, M. A. Lanata, C. F. Lufesi, N. Mackenzie, G. A. McCracken, J. P. Moschovis, P. P. Nair, H. Oviawe, O. Pomat, W. S. Santosham, M. Seddon, J. A. Thahane, L. K. Wahl, B. Van der Zalm, M. Verwey, C. Yoshida, L. M. Zar, H. J. Howie, S. R. McCollum, E. D.
BMJ Glob Health, (2020). 5:

Effects of vitamin D deficiency on neurobehavioural outcomes in children: a systematic review.Mutua, A. M. Mogire, R. M. Elliott, A. M. Williams, T. N. Webb, E. L. Abubakar, A. Atkinson, S. H.
Wellcome Open Res, (2020). 5:28

beta-Thalassemia pathogenic variants in a cohort of children from the East African coast.Macharia, A. W. Mochamah, G. Uyoga, S. Ndila, C. M. Nyutu, G. Tendwa, M. Nyatichi, E. Makale, J. Ware, R. E. Williams, T. N.
Mol Genet Genomic Med, (2020). 8:e1294

Caring for Africa's sickle cell children: will we rise to the challenge?.Oron, A. P. Chao, D. L. Ezeanolue, E. E. Ezenwa, L. N. Piel, F. B. Ojogun, O. T. Uyoga, S. Williams, T. N. Nnodu, O. E.
BMC Med, (2020). 18:92