Publications

Biosciences

National prevalence and risk factors for tungiasis in Kenya.Elson, L. Kamau, C. Koech, S. Muthama, C. Gachomba, G. Sinoti, E. Chondo, E. Mburu, E. Wakio, M. Lore, J. Maia, M. Adetifa, I. Orindi, B. Bejon, P. Fillinger, U.
Infect Dis Poverty, (2023). 12:85

New SARS-CoV-2 Omicron Variant with Spike Protein Mutation Y451H, Kilifi, Kenya, March-May 2023.Mwanga, M. J. Lambisia, A. W. Morobe, J. M. Murunga, N. Moraa, E. Ndwiga, L. Cheruiyot, R. Musyoki, J. Mutunga, M. Guzman-Rincon, L. M. Sande, C. Mwangangi, J. Bejon, P. Ochola-Oyier, L. I. Nokes, D. J. Agoti, C. N. Nyiro, J. Githinji, G.
Emerg Infect Dis, (2023). 29:2376-2379

Pre-vaccination monocyte-to-lymphocyte ratio as a biomarker for the efficacy of malaria candidate vaccines: A subgroup analysis of pooled clinical trial data.Nyandele, J. P. Kibondo, U. A. Issa, F. Van Geertruyden, J. P. Warimwe, G. Jongo, S. Abdulla, S. Olotu, A.
PLoS One, (2023). 18:e0291244

Effects of larval exposure to sublethal doses of ivermectin on adult fitness and susceptibility to ivermectin in Anopheles gambiae s.s.Kiuru, C. Ominde, K. Muturi, M. Babu, L. Wanjiku, C. Chaccour, C. Maia, M. F.
Parasit Vectors, (2023). 16:293

Topical repellents for malaria prevention.Gabaldon Figueira, J. C. Wagah, M. G. Adipo, L. B. Wanjiku, C. Maia, M. F.
Cochrane Database Syst Rev, (2023). 8:CD015422

Sporozoite immunization: innovative translational science to support the fight against malaria.Richie, T. L. Church, L. W. P. Murshedkar, T. Billingsley, P. F. James, E. R. Chen, M. C. Abebe, Y. K, C. N. Chakravarty, S. Dolberg, D. Healy, S. A. Diawara, H. Sissoko, M. S. Sagara, I. Cook, D. M. Epstein, J. E. Mordmuller, B. Kapulu, M. Kreidenweiss, A. Franke-Fayard, B. Agnandji, S. T. Lopez Mikue, M. A. McCall, M. B. B. Steinhardt, L. Oneko, M. Olotu, A. Vaughan, A. M. Kublin, J. G. Murphy, S. C. Jongo, S. Tanner, M. Sirima, S. B. Laurens, M. B. Daubenberger, C. Silva, J. C. Lyke, K. E. Janse, C. J. Roestenberg, M. Sauerwein, R. W. Abdulla, S. Dicko, A. Kappe, S. H. I. Sim, B. K. L. Duffy, P. E. Kremsner, P. G. Hoffman, S. L.
Expert Rev Vaccines, (2023). 22:964-1007

A Customizable Suite of Methods to Sequence and Annotate Cattle Antibodies.Ramirez Valdez, K. Nzau, B. Dorey-Robinson, D. Jarman, M. Nyagwange, J. Schwartz, J. C. Freimanis, G. Steyn, A. W. Warimwe, G. M. Morrison, L. J. Mwangi, W. Charleston, B. Bonnet-Di Placido, M. Hammond, J. A.
Vaccines (Basel), (2023). 11:

The Dantu blood group prevents parasite growth in vivo: Evidence from a controlled human malaria infection study.Kariuki, S. N. Macharia, A. W. Makale, J. Nyamu, W. Hoffman, S. L. Kapulu, M. C. Bejon, P. Rayner, J. C. Williams, T. N. Chmi-Sika Study Team
Elife, (2023). 12:

Correlations between three ELISA protocols measurements of RTS,S/AS01-induced anti-CSP IgG antibodies.Mugo, R. M. Orindi, B. Shee, F. M. Bellamy, D. Mwacharo, J. Ewer, K. J. Bejon, P. Ndungu, F. M.
PLoS One, (2023). 18:e0286117

Immunogenicity and safety of fractional doses of 17D-213 yellow fever vaccine in children (YEFE): a randomised, double-blind, non-inferiority substudy of a phase 4 trial.Juan-Giner, A. Namulwana, M. L. Kimathi, D. Grantz, K. H. Fall, G. Dia, M. Bob, N. S. Sall, A. A. Nerima, C. Sahani, M. K. Mulogo, E. M. Ampeire, I. Hombach, J. Nanjebe, D. Mwanga-Amumpaire, J. Cummings, D. A. T. Bejon, P. Warimwe, G. M. Grais, R. F.
Lancet Infect Dis, (2023). 23:965-973

Immunogenicity and safety of fractional doses of 17D-213 yellow fever vaccine in HIV-infected people in Kenya (YEFE): a randomised, double-blind, non-inferiority substudy of a phase 4 trial.Kimathi, D. Juan-Giner, A. Orindi, B. Grantz, K. H. Bob, N. S. Cheruiyot, S. Hamaluba, M. Kamau, N. Fall, G. Dia, M. Mosobo, M. Moki, F. Kiogora, K. Chirro, O. Thiong'o, A. Mwendwa, J. Guantai, A. Karanja, H. K. Gitonga, J. Mugo, D. Ramko, K. Faye, O. Sanders, E. J. Grais, R. F. Bejon, P. Warimwe, G. M.
Lancet Infect Dis, (2023). 23:974-982

Spatial heterogeneity of low-birthweight deliveries on the Kenyan coast.Musau, M. M. Mwakio, S. Amadi, D. Nyaguara, A. Bejon, P. Berkley, J. A. Snow, R. W. Kamau, A.
BMC Pregnancy Childbirth, (2023). 23:270

Plasmodium falciparum adapts its investment into replication versus transmission according to the host environment.Abdi, A. I. Achcar, F. Sollelis, L. Silva-Filho, J. L. Mwikali, K. Muthui, M. Mwangi, S. Kimingi, H. W. Orindi, B. Andisi Kivisi, C. Alkema, M. Chandrasekar, A. Bull, P. C. Bejon, P. Modrzynska, K. Bousema, T. Marti, M.
Elife, (2023). 12:

Pf7: an open dataset of Plasmodium falciparum genome variation in 20,000 worldwide samples.MalariaGen, Abdel Hamid, M. M. Abdelraheem, M. H. Acheampong, D. O. Ahouidi, A. Ali, M. Almagro-Garcia, J. Amambua-Ngwa, A. Amaratunga, C. Amenga-Etego, L. Andagalu, B. Anderson, T. Andrianaranjaka, V. Aniebo, I. Aninagyei, E. Ansah, F. Ansah, P. O. Apinjoh, T. Arnaldo, P. Ashley, E. Auburn, S. Awandare, G. A. Ba, H. Baraka, V. Barry, A. Bejon, P. Bertin, G. I. Boni, M. F. Borrmann, S. Bousema, T. Bouyou-Akotet, M. Branch, O. Bull, P. C. Cheah, H. Chindavongsa, K. Chookajorn, T. Chotivanich, K. Claessens, A. Conway, D. J. Corredor, V. Courtier, E. Craig, A. D'Alessandro, U. Dama, S. Day, N. Denis, B. Dhorda, M. Diakite, M. Djimde, A. Dolecek, C. Dondorp, A. Doumbia, S. Drakeley, C. Drury, E. Duffy, P. Echeverry, D. F. Egwang, T. G. Enosse, S. M. M. Erko, B. Fairhurst, R. M. Faiz, A. Fanello, C. A. Fleharty, M. Forbes, M. Fukuda, M. Gamboa, D. Ghansah, A. Golassa, L. Goncalves, S. Harrison, G. L. A. Healy, S. A. Hendry, J. A. Hernandez-Koutoucheva, A. Hien, T. T. Hill, C. A. Hombhanje, F. Hott, A. Htut, Y. Hussein, M. Imwong, M. Ishengoma, D. Jackson, S. A. Jacob, C. G. Jeans, J. Johnson, K. J. Kamaliddin, C. Kamau, E. Keatley, J. Kochakarn, T. Konate, D. S. Konate, A. Kone, A. Kwiatkowski, D. P. Kyaw, M. P. Kyle, D. Lawniczak, M. Lee, S. K. Lemnge, M. Lim, P. Lon, C. Loua, K. M. Mandara, C. I. Marfurt, J. Marsh, K. Maude, R. J. Mayxay, M. Maiga-Ascofare, O. Miotto, O. Mita, T. Mobegi, V. Mohamed, A. O. Mokuolu, O. A. Montgomery, J. Morang'a, C. M. Mueller, I. Murie, K. Newton, P. N. Ngo Duc, T. Nguyen, T. Nguyen, T. N. Nguyen Thi Kim, T. Nguyen Van, H. Noedl, H. Nosten, F. Noviyanti, R. Ntui, V. N. Nzila, A. Ochola-Oyier, L. I. Ocholla, H. Oduro, A. Omedo, I. Onyamboko, M. A. Ouedraogo, J. B. Oyebola, K. Oyibo, W. A. Pearson, R. Peshu, N. Phyo, A. P. Plowe, C. V. Price, R. N. Pukrittayakamee, S. Quang, H. H. Randrianarivelojosia, M. Rayner, J. C. Ringwald, P. Rosanas-Urgell, A. Rovira-Vallbona, E. Ruano-Rubio, V. Ruiz, L. Saunders, D. Shayo, A. Siba, P. Simpson, V. J. Sissoko, M. S. Smith, C. Su, X. Z. Sutherland, C. Takala-Harrison, S. Talman, A. Tavul, L. Thanh, N. V. Thathy, V. Thu, A. M. Toure, M. Tshefu, A. Verra, F. Vinetz, J. Wellems, T. E. Wendler, J. White, N. J. Whitton, G. Yavo, W. van der Pluijm, R. W.
Wellcome Open Res, (2023). 8:22

Validation of saline, PBS and a locally produced VTM at varying storage conditions to detect the SARS-CoV-2 virus by qRT-PCR.Ngetsa, C. Osoti, V. Okanda, D. Marura, F. Shah, K. Karanja, H. Mugo, D. Gitonga, J. Mutunga, M. Lewa, C. Orindi, B. Bejon, P. Ochola-Oyier, L. I.
PLoS One, (2023). 18:e0280685

Anti-merozoite antibodies induce natural killer cell effector function and are associated with immunity against malaria.Odera, D. O. Tuju, J. Mwai, K. Nkumama, I. N. Furle, K. Chege, T. Kimathi, R. Diehl, S. Musasia, F. K. Rosenkranz, M. Njuguna, P. Hamaluba, M. Kapulu, M. C. Frank, R. Chmi-Sika Study Team Osier, F. H. A. Abdi, A. I. Chi, P. C. de Laurent, Z. Jao, I. Kamuya, D. Kamuyu, G. Makale, J. Murungi, L. Musyoki, J. Muthui, M. Mwacharo, J. Kariuki, S. Mwanga, D. Mwongeli, J. Ndungu, F. Njue, M. Nyangweso, G. Kimani, D. Ngoi, J. M. Musembi, J. Ngoto, O. Otieno, E. Ooko, M. Shangala, J. Wambua, J. Mohammed, K. S. Omuoyo, D. Mosobo, M. Kibinge, N. Kinyanjui, S. Bejon, P. Lowe, B. Marsh, K. Marsh, V. Abebe, Y. Billingsley, P. F. Sim, B. K. L. Hoffman, S. L. James, E. R. Richie, T. L. Audi, A. Olewe, F. Oloo, J. Ongecha, J. Ongas, M. O. Koskei, N. Bull, P. C. Hodgson, S. H. Kivisi, C. Imwong, M. Murphy, S. C. Ogutu, B. Tarning, J. Winterberg, M. Williams, T. N.
Sci Transl Med, (2023). 15:eabn5993

Comparison of Structural Changes in Nodding Syndrome and Other Epilepsies Associated With Onchocerca volvulus.Mazumder, R. Lubowa, S. K. Salamon, N. Jackson, N. J. Kawooya, M. Akun, P. R. Anguzu, R. Ogwang, R. J. Kubofcik, J. Nutman, T. Marsh, K. Newton, C. Vincent, A. Idro, R.
Neurol Neuroimmunol Neuroinflamm, (2023). 10:

Serum immunoglobulin G and mucosal immunoglobulin A antibodies from prepandemic samples collected in Kilifi, Kenya, neutralize SARS-CoV-2 in vitro.Nyagwange, J. Kutima, B. Mwai, K. Karanja, H. K. Gitonga, J. N. Mugo, D. Sein, Y. Wright, D. Omuoyo, D. O. Nyiro, J. U. Tuju, J. Nokes, D. J. Agweyu, A. Bejon, P. Ochola-Oyier, L. I. Scott, J. A. G. Lambe, T. Nduati, E. Agoti, C. Warimwe, G. M.
Int J Infect Dis, (2023). 127:11-16

Impact of Intermittent Presumptive Treatment for Malaria in Pregnancy on Hospital Birth Outcomes on the Kenyan Coast.Kamau, A. Musau, M. Mwakio, S. Amadi, D. Nyaguara, A. Bejon, P. Seale, A. C. Berkley, J. A. Snow, R. W.
Clin Infect Dis, (2023). 76:e875-e883

A pragmatic randomized controlled trial of standard care versus corticosteroids plus standard care for treatment of pneumonia in adults admitted to Kenyan hospitals (SONIA).Lucinde, R. Abdi, A. Orindi, B. Mwakio, S. Gathuri, H. Onyango, E. Chira, S. Ogero, M. Isaaka, L. Shangala, J. Oginga, I. N. Wachira, A. Manuthu, E. Kariuki, H. Nyikuli, J. Wekesa, C. Otedo, A. Bosire, H. Okoth, S. B. Ongalo, W. Mukabi, D. Lusamba, W. Muthui, B. Kirui, N. Adembesa, I. Mithi, C. Sood, M. Ahmed, N. Gituma, B. Ongaki, V. B. Giabe, M. Omondi, C. Ombajo, L. A. Kagucia, W. English, M. Hamaluba, M. Ochola-Oyier, L. I. Kamuya, D. Bejon, P. Agweyu, A. Akech, S. Etyang, A. O.
Wellcome Open Res, (2022). 7:269