Publications

Epidemiology and Demography

Global, regional, and national disability-adjusted life years (DALYs) for 306 diseases and injuries and healthy life expectancy (HALE) for 188 countries, 1990-2013: quantifying the epidemiological transition.G. B. D. DALYs Hale Collaborators Murray, C. J. Barber, R. M. Foreman, K. J. Abbasoglu Ozgoren, A. Abd-Allah, F. Abera, S. F. Aboyans, V. Abraham, J. P. Abubakar, I. Abu-Raddad, L. J. Abu-Rmeileh, N. M. Achoki, T. Ackerman, I. N. Ademi, Z. Adou, A. K. Adsuar, J. C. Afshin, A. Agardh, E. E. Alam, S. S. Alasfoor, D. Albittar, M. I. Alegretti, M. A. Alemu, Z. A. Alfonso-Cristancho, R. Alhabib, S. Ali, R. Alla, F. Allebeck, P. Almazroa, M. A. Alsharif, U. Alvarez, E. Alvis-Guzman, N. Amare, A. T. Ameh, E. A. Amini, H. Ammar, W. Anderson, H. R. Anderson, B. O. Antonio, C. A. Anwari, P. Arnlov, J. Arsic Arsenijevic, V. S. Artaman, A. Asghar, R. J. Assadi, R. Atkins, L. S. Avila, M. A. Awuah, B. Bachman, V. F. Badawi, A. Bahit, M. C. Balakrishnan, K. Banerjee, A. Barker-Collo, S. L. Barquera, S. Barregard, L. Barrero, L. H. Basu, A. Basu, S. Basulaiman, M. O. Beardsley, J. Bedi, N. Beghi, E. Bekele, T. Bell, M. L. Benjet, C. Bennett, D. A. Bensenor, I. M. Benzian, H. Bernabe, E. Bertozzi-Villa, A. Beyene, T. J. Bhala, N. Bhalla, A. Bhutta, Z. A. Bienhoff, K. Bikbov, B. Biryukov, S. Blore, J. D. Blosser, C. D. Blyth, F. M. Bohensky, M. A. Bolliger, I. W. Bora Basara, B. Bornstein, N. M. Bose, D. Boufous, S. Bourne, R. R. Boyers, L. N. Brainin, M. Brayne, C. E. Brazinova, A. Breitborde, N. J. Brenner, H. Briggs, A. D. Brooks, P. M. Brown, J. C. Brugha, T. S. Buchbinder, R. Buckle, G. C. Budke, C. M. Bulchis, A. Bulloch, A. G. Campos-Nonato, I. R. Carabin, H. Carapetis, J. R. Cardenas, R. Carpenter, D. O. Caso, V. Castaneda-Orjuela, C. A. Castro, R. E. Catala-Lopez, F. Cavalleri, F. Cavlin, A. Chadha, V. K. Chang, J. C. Charlson, F. J. Chen, H. Chen, W. Chiang, P. P. Chimed-Ochir, O. Chowdhury, R. Christensen, H. Christophi, C. A. Cirillo, M. Coates, M. M. Coffeng, L. E. Coggeshall, M. S. Colistro, V. Colquhoun, S. M. Cooke, G. S. Cooper, C. Cooper, L. T. Coppola, L. M. Cortinovis, M. Criqui, M. H. Crump, J. A. Cuevas-Nasu, L. Danawi, H. Dandona, L. Dandona, R. Dansereau, E. Dargan, P. I. Davey, G. Davis, A. Davitoiu, D. V. Dayama, A. De Leo, D. Degenhardt, L. Del Pozo-Cruz, B. Dellavalle, R. P. Deribe, K. Derrett, S. Des Jarlais, D. C. Dessalegn, M. Dharmaratne, S. D. Dherani, M. K. Diaz-Torne, C. Dicker, D. Ding, E. L. Dokova, K. Dorsey, E. R. Driscoll, T. R. Duan, L. Duber, H. C. Ebel, B. E. Edmond, K. M. Elshrek, Y. M. Endres, M. Ermakov, S. P. Erskine, H. E. Eshrati, B. Esteghamati, A. Estep, K. Faraon, E. J. Farzadfar, F. Fay, D. F. Feigin, V. L. Felson, D. T. Fereshtehnejad, S. M. Fernandes, J. G. Ferrari, A. J. Fitzmaurice, C. Flaxman, A. D. Fleming, T. D. Foigt, N. Forouzanfar, M. H. Fowkes, F. G. Paleo, U. F. Franklin, R. C. Furst, T. Gabbe, B. Gaffikin, L. Gankpe, F. G. Geleijnse, J. M. Gessner, B. D. Gething, P. Gibney, K. B. Giroud, M. Giussani, G. Gomez Dantes, H. Gona, P. Gonzalez-Medina, D. Gosselin, R. A. Gotay, C. C. Goto, A. Gouda, H. N. Graetz, N. Gugnani, H. C. Gupta, R. Gupta, R. Gutierrez, R. A. Haagsma, J. Hafezi-Nejad, N. Hagan, H. Halasa, Y. A. Hamadeh, R. R. Hamavid, H. Hammami, M. Hancock, J. Hankey, G. J. Hansen, G. M. Hao, Y. Harb, H. L. Haro, J. M. Havmoeller, R. Hay, S. I. Hay, R. J. Heredia-Pi, I. B. Heuton, K. R. Heydarpour, P. Higashi, H. Hijar, M. Hoek, H. W. Hoffman, H. J. Hosgood, H. D. Hossain, M. Hotez, P. J. Hoy, D. G. Hsairi, M. Hu, G. Huang, C. Huang, J. J. Husseini, A. Huynh, C. Iannarone, M. L. Iburg, K. M. Innos, K. Inoue, M. Islami, F. Jacobsen, K. H. Jarvis, D. L. Jassal, S. K. Jee, S. H. Jeemon, P. Jensen, P. N. Jha, V. Jiang, G. Jiang, Y. Jonas, J. B. Juel, K. Kan, H. Karch, A. Karema, C. K. Karimkhani, C. Karthikeyan, G. Kassebaum, N. J. Kaul, A. Kawakami, N. Kazanjan, K. Kemp, A. H. Kengne, A. P. Keren, A. Khader, Y. S. Khalifa, S. E. Khan, E. A. Khan, G. Khang, Y. H. Kieling, C. Kim, D. Kim, S. Kim, Y. Kinfu, Y. Kinge, J. M. Kivipelto, M. Knibbs, L. D. Knudsen, A. K. Kokubo, Y. Kosen, S. Krishnaswami, S. Kuate Defo, B. Kucuk Bicer, B. Kuipers, E. J. Kulkarni, C. Kulkarni, V. S. Kumar, G. A. Kyu, H. H. Lai, T. Lalloo, R. Lallukka, T. Lam, H. Lan, Q. Lansingh, V. C. Larsson, A. Lawrynowicz, A. E. Leasher, J. L. Leigh, J. Leung, R. Levitz, C. E. Li, B. Li, Y. Li, Y. Lim, S. S. Lind, M. Lipshultz, S. E. Liu, S. Liu, Y. Lloyd, B. K. Lofgren, K. T. Logroscino, G. Looker, K. J. Lortet-Tieulent, J. Lotufo, P. A. Lozano, R. Lucas, R. M. Lunevicius, R. Lyons, R. A. Ma, S. Macintyre, M. F. Mackay, M. T. Majdan, M. Malekzadeh, R. Marcenes, W. Margolis, D. J. Margono, C. Marzan, M. B. Masci, J. R. Mashal, M. T. Matzopoulos, R. Mayosi, B. M. Mazorodze, T. T. McGill, N. W. McGrath, J. J. McKee, M. McLain, A. Meaney, P. A. Medina, C. Mehndiratta, M. M. Mekonnen, W. Melaku, Y. A. Meltzer, M. Memish, Z. A. Mensah, G. A. Meretoja, A. Mhimbira, F. A. Micha, R. Miller, T. R. Mills, E. J. Mitchell, P. B. Mock, C. N. Mohamed Ibrahim, N. Mohammad, K. A. Mokdad, A. H. Mola, G. L. Monasta, L. Montanez Hernandez, J. C. Montico, M. Montine, T. J. Mooney, M. D. Moore, A. R. Moradi-Lakeh, M. Moran, A. E. Mori, R. Moschandreas, J. Moturi, W. N. Moyer, M. L. Mozaffarian, D. Msemburi, W. T. Mueller, U. O. Mukaigawara, M. Mullany, E. C. Murdoch, M. E. Murray, J. Murthy, K. S. Naghavi, M. Naheed, A. Naidoo, K. S. Naldi, L. Nand, D. Nangia, V. Narayan, K. M. Nejjari, C. Neupane, S. P. Newton, C. R. Ng, M. Ngalesoni, F. N. Nguyen, G. Nisar, M. I. Nolte, S. Norheim, O. F. Norman, R. E. Norrving, B. Nyakarahuka, L. Oh, I. H. Ohkubo, T. Ohno, S. L. Olusanya, B. O. Opio, J. N. Ortblad, K. Ortiz, A. Pain, A. W. Pandian, J. D. Panelo, C. I. Papachristou, C. Park, E. K. Park, J. H. Patten, S. B. Patton, G. C. Paul, V. K. Pavlin, B. I. Pearce, N. Pereira, D. M. Perez-Padilla, R. Perez-Ruiz, F. Perico, N. Pervaiz, A. Pesudovs, K. Peterson, C. B. Petzold, M. Phillips, M. R. Phillips, B. K. Phillips, D. E. Piel, F. B. Plass, D. Poenaru, D. Polinder, S. Pope, D. Popova, S. Poulton, R. G. Pourmalek, F. Prabhakaran, D. Prasad, N. M. Pullan, R. L. Qato, D. M. Quistberg, D. A. Rafay, A. Rahimi, K. Rahman, S. U. Raju, M. Rana, S. M. Razavi, H. Reddy, K. S. Refaat, A. Remuzzi, G. Resnikoff, S. Ribeiro, A. L. Richardson, L. Richardus, J. H. Roberts, D. A. Rojas-Rueda, D. Ronfani, L. Roth, G. A. Rothenbacher, D. Rothstein, D. H. Rowley, J. T. Roy, N. Ruhago, G. M. Saeedi, M. Y. Saha, S. Sahraian, M. A. Sampson, U. K. Sanabria, J. R. Sandar, L. Santos, I. S. Satpathy, M. Sawhney, M. Scarborough, P. Schneider, I. J. Schottker, B. Schumacher, A. E. Schwebel, D. C. Scott, J. G. Seedat, S. Sepanlou, S. G. Serina, P. T. Servan-Mori, E. E. Shackelford, K. A. Shaheen, A. Shahraz, S. Shamah Levy, T. Shangguan, S. She, J. Sheikhbahaei, S. Shi, P. Shibuya, K. Shinohara, Y. Shiri, R. Shishani, K. Shiue, I. Shrime, M. G. Sigfusdottir, I. D. Silberberg, D. H. Simard, E. P. Sindi, S. Singh, A. Singh, J. A. Singh, L. Skirbekk, V. Slepak, E. L. Sliwa, K. Soneji, S. Soreide, K. Soshnikov, S. Sposato, L. A. Sreeramareddy, C. T. Stanaway, J. D. Stathopoulou, V. Stein, D. J. Stein, M. B. Steiner, C. Steiner, T. J. Stevens, A. Stewart, A. Stovner, L. J. Stroumpoulis, K. Sunguya, B. F. Swaminathan, S. Swaroop, M. Sykes, B. L. Tabb, K. M. Takahashi, K. Tandon, N. Tanne, D. Tanner, M. Tavakkoli, M. Taylor, H. R. Te Ao, B. J. Tediosi, F. Temesgen, A. M. Templin, T. Ten Have, M. Tenkorang, E. Y. Terkawi, A. S. Thomson, B. Thorne-Lyman, A. L. Thrift, A. G. Thurston, G. D. Tillmann, T. Tonelli, M. Topouzis, F. Toyoshima, H. Traebert, J. Tran, B. X. Trillini, M. Truelsen, T. Tsilimbaris, M. Tuzcu, E. M. Uchendu, U. S. Ukwaja, K. N. Undurraga, E. A. Uzun, S. B. Van Brakel, W. H. Van De Vijver, S. van Gool, C. H. Van Os, J. Vasankari, T. J. Venketasubramanian, N. Violante, F. S. Vlassov, V. V. Vollset, S. E. Wagner, G. R. Wagner, J. Waller, S. G. Wan, X. Wang, H. Wang, J. Wang, L. Warouw, T. S. Weichenthal, S. Weiderpass, E. Weintraub, R. G. Wenzhi, W. Werdecker, A. Westerman, R. Whiteford, H. A. Wilkinson, J. D. Williams, T. N. Wolfe, C. D. Wolock, T. M. Woolf, A. D. Wulf, S. Wurtz, B. Xu, G. Yan, L. L. Yano, Y. Ye, P. Yentur, G. K. Yip, P. Yonemoto, N. Yoon, S. J. Younis, M. Z. Yu, C. Zaki, M. E. Zhao, Y. Zheng, Y. Zonies, D. Zou, X. Salomon, J. A. Lopez, A. D. Vos, T.
Lancet, (2015). 386:2145-91

Amoxicillin equivalent to parenteral antibiotics in the treatment of resource-deficient infants with tachypnea.Agweyu, A.
J Pediatr, (2015). 167:778-9

Genetic determinants of anti-malarial acquired immunity in a large multi-centre study.Shelton, J. M. Corran, P. Risley, P. Silva, N. Hubbart, C. Jeffreys, A. Rowlands, K. Craik, R. Cornelius, V. Hensmann, M. Molloy, S. Sepulveda, N. Clark, T. G. Band, G. Clarke, G. M. Spencer, C. C. Kerasidou, A. Campino, S. Auburn, S. Tall, A. Ly, A. B. Mercereau-Puijalon, O. Sakuntabhai, A. Djimde, A. Maiga, B. Toure, O. Doumbo, O. K. Dolo, A. Troye-Blomberg, M. Mangano, V. D. Verra, F. Modiano, D. Bougouma, E. Sirima, S. B. Ibrahim, M. Hussain, A. Eid, N. Elzein, A. Mohammed, H. Elhassan, A. Elhassan, I. Williams, T. N. Ndila, C. Macharia, A. Marsh, K. Manjurano, A. Reyburn, H. Lemnge, M. Ishengoma, D. Carter, R. Karunaweera, N. Fernando, D. Dewasurendra, R. Drakeley, C. J. Riley, E. M. Kwiatkowski, D. P. Rockett, K. A. Malaria, G. E. N. Consortium
Malar J, (2015). 14:333

Genetic variants associated with non-typhoidal Salmonella bacteraemia in African children.Gilchrist, J. J. Mills, T. C. Naranbhai, V. Chapman, S. J. Fairfax, B. P. Knight, J. C. Williams, T. N. Scott, J. A. MacLennan, C. A. Rautanen, A. Hill, A. V. Wellcome Trust Case Control, Consortium
Lancet, (2015). 385 Suppl 1:S13

Identifying children with excess malaria episodes after adjusting for variation in exposure: identification from a longitudinal study using statistical count models.Ndungu, F. M. Marsh, K. Fegan, G. Wambua, J. Nyangweso, G. Ogada, E. Mwangi, T. Nyundo, C. Macharia, A. Uyoga, S. Williams, T. N. Bejon, P.
BMC Med, (2015). 13:183

Predicting mortality in sick African children: the FEAST Paediatric Emergency Triage (PET) Score.George, E. C. Walker, A. S. Kiguli, S. Olupot-Olupot, P. Opoka, R. O. Engoru, C. Akech, S. O. Nyeko, R. Mtove, G. Reyburn, H. Berkley, J. A. Mpoya, A. Levin, M. Crawley, J. Gibb, D. M. Maitland, K. Babiker, A. G.
BMC Med, (2015). 13:174

Effects of Vaccination with 10-Valent Pneumococcal Non-Typeable Haemophilus influenza Protein D Conjugate Vaccine (PHiD-CV) on the Nasopharyngeal Microbiome of Kenyan Toddlers.Feazel, L. M. Santorico, S. A. Robertson, C. E. Bashraheil, M. Scott, J. A. Frank, D. N. Hammitt, L. L.
PLoS One, (2015). 10:e0128064

The Potential for Reducing the Number of Pneumococcal Conjugate Vaccine Doses While Sustaining Herd Immunity in High-Income Countries.Flasche, S. Van Hoek, A. J. Goldblatt, D. Edmunds, W. J. O'Brien, K. L. Scott, J. A. Miller, E.
PLoS Med, (2015). 12:e1001839

An unsupported preference for intravenous antibiotics.Li, H. K. Agweyu, A. English, M. Bejon, P.
PLoS Med, (2015). 12:e1001825

Frequent Asymptomatic Respiratory Syncytial Virus Infections During an Epidemic in a Rural Kenyan Household Cohort.Munywoki, P. K. Koech, D. C. Agoti, C. N. Bett, A. Cane, P. A. Medley, G. F. Nokes, D. J.
J Infect Dis, (2015). 212:1711-8

10-valent pneumococcal non-typeable Haemophilus influenzae protein-D conjugate vaccine (PHiD-CV) induces memory B cell responses in healthy Kenyan toddlers.Muema, D. M. Nduati, E. W. Uyoga, M. Bashraheil, M. Scott, J. A. Hammitt, L. L. Urban, B. C.
Clin Exp Immunol, (2015). 181:297-305

Quantifying maternally derived respiratory syncytial virus specific neutralising antibodies in a birth cohort from coastal Kenya.Nyiro, J. U. Sande, C. Mutunga, M. Kiyuka, P. K. Munywoki, P. K. Scott, J. A. Nokes, D. J.
Vaccine, (2015). 33:1797-801

Burden, causes, and outcomes of people with epilepsy admitted to a rural hospital in Kenya.Kariuki, S. M. Chengo, E. Ibinda, F. Odhiambo, R. Etyang, A. Ngugi, A. K. Newton, C. R.
Epilepsia, (2015). 56:577-84

Anaemia and blood transfusion in African children presenting to hospital with severe febrile illness.Kiguli, S. Maitland, K. George, E. C. Olupot-Olupot, P. Opoka, R. O. Engoru, C. Akech, S. O. Nyeko, R. Mtove, G. Reyburn, H. Levin, M. Babiker, A. G. Gibb, D. M. Crawley, J.
BMC Med, (2015). 13:21

Local evolutionary patterns of human respiratory syncytial virus derived from whole-genome sequencing.Agoti, C. N. Otieno, J. R. Munywoki, P. K. Mwihuri, A. G. Cane, P. A. Nokes, D. J. Kellam, P. Cotten, M.
J Virol, (2015). 89:3444-54

Oral amoxicillin versus benzyl penicillin for severe pneumonia among kenyan children: a pragmatic randomized controlled noninferiority trial.Agweyu, A. Gathara, D. Oliwa, J. Muinga, N. Edwards, T. Allen, E. Maleche-Obimbo, E. English, M. Severe Pneumonia Study, Group
Clin Infect Dis, (2015). 60:1216-24

Sickle cell disease: a neglected chronic disease of increasing global health importance.Chakravorty, S. Williams, T. N.
Arch Dis Child, (2015). 100:48-53

Influence of age, severity of infection, and co-infection on the duration of respiratory syncytial virus (RSV) shedding.Munywoki, P. K. Koech, D. C. Agoti, C. N. Kibirige, N. Kipkoech, J. Cane, P. A. Medley, G. F. Nokes, D. J.
Epidemiol Infect, (2015). 143:804-12

Sickle Cell Anemia: history and epidemiology.Piel, F.B. Williams, T.N.
Sickle Cell Anemia: from basic science to clinical practice, (2015). :

Sickle Cell Disease in sub-Saharan Africa.Williams, T.N.
Global Hematology/Oncology Clinics of North America, (2015). :