Publications

Epidemiology and Demography

TRUE-1: Trial of Repurposed Unithiol for snakebite Envenoming phase 1 (safety, tolerability, pharmacokinetics and pharmacodynamics in healthy Kenyan adults).Abouyannis, M. FitzGerald, R. Ngama, M. Mwangudzah, H. Nyambura, Y. K. Ngome, S. Riako, D. Babu, L. Lewa, F. Else, L. Dily Penchala, S. Orindi, B. Mumba, N. Kalama, B. Ndungu, F. M. Adetifa, I. Khoo, S. Lalloo, D. G. Casewell, N. R. Hamaluba, M.
Wellcome Open Res, (2022). 7:90

Scaling up the primary health integrated care project for chronic conditions in Kenya: study protocol for an implementation research project.Nolte, E. Kamano, J. H. Naanyu, V. Etyang, A. Gasparrini, A. Hanson, K. Koros, H. Mugo, R. Murphy, A. Oyando, R. Pliakas, T. Were, V. Willis, R. Barasa, E. Perel, P.
BMJ Open, (2022). 12:e056261

Optimization of the SARS-CoV-2 ARTIC Network V4 Primers and Whole Genome Sequencing Protocol.Lambisia, A. W. Mohammed, K. S. Makori, T. O. Ndwiga, L. Mburu, M. W. Morobe, J. M. Moraa, E. O. Musyoki, J. Murunga, N. Mwangi, J. N. Nokes, D. J. Agoti, C. N. Ochola-Oyier, L. I. Githinji, G.
Front Med (Lausanne), (2022). 9:836728

Filling the data gaps on sickle cell anaemia in sub-Saharan Africa.Williams, T. N.
Lancet Haematol, (2022). 9:e172-e173

WHO preferred product characteristics for monoclonal antibodies for passive immunization against respiratory syncytial virus (RSV) disease in infants - Key considerations for global use.Sparrow, E. Adetifa, I. Chaiyakunapruk, N. Cherian, T. Fell, D. B. Graham, B. S. Innis, B. Kaslow, D. C. Karron, R. A. Nair, H. Neuzil, K. M. Saha, S. Smith, P. G. Srikantiah, P. Were, F. Zar, H. J. Feikin, D.
Vaccine, (2022). 40:3506-3510

Unmet need for COVID-19 vaccination coverage in Kenya.Muchiri, S. K. Muthee, R. Kiarie, H. Sitienei, J. Agweyu, A. Atkinson, P. M. Edson Utazi, C. Tatem, A. J. Alegana, V. A.
Vaccine, (2022). 40:2011-2019

Whole blood versus red cell concentrates for children with severe anaemia: a secondary analysis of the Transfusion and Treatment of African Children (TRACT) trial.George, E. C. Uyoga, S. M'Baya, B. Kyeyune Byabazair, D. Kiguli, S. Olupot-Olupot, P. Opoka, R. O. Chagaluka, G. Alaroker, F. Williams, T. N. Bates, I. Mbanya, D. Gibb, D. M. Walker, A. S. Maitland, K. Tract trial study group
Lancet Glob Health, (2022). 10:e360-e368

A predictive algorithm for identifying children with sickle cell anemia among children admitted to hospital with severe anemia in Africa.Olupot-Olupot, P. Connon, R. Kiguli, S. Opoka, R. O. Alaroker, F. Uyoga, S. Nakuya, M. Okiror, W. Nteziyaremye, J. Ssenyondo, T. Nabawanuka, E. Kayaga, J. Williams Mukisa, C. Amorut, D. Muhindo, R. Frost, G. Walsh, K. Macharia, A. W. Gibb, D. M. Walker, A. S. George, E. C. Maitland, K. Williams, T. N.
Am J Hematol, (2022). 97:527-536

Malaria hospitalisation in East Africa: age, phenotype and transmission intensity.Kamau, A. Paton, R. S. Akech, S. Mpimbaza, A. Khazenzi, C. Ogero, M. Mumo, E. Alegana, V. A. Agweyu, A. Mturi, N. Mohammed, S. Bigogo, G. Audi, A. Kapisi, J. Sserwanga, A. Namuganga, J. F. Kariuki, S. Otieno, N. A. Nyawanda, B. O. Olotu, A. Salim, N. Athuman, T. Abdulla, S. Mohamed, A. F. Mtove, G. Reyburn, H. Gupta, S. Lourenco, J. Bejon, P. Snow, R. W.
BMC Med, (2022). 20:28

Identification of missed viruses by metagenomic sequencing of clinical respiratory samples from Kenya.Phan, M. V. T. Agoti, C. N. Munywoki, P. K. Otieno, G. P. Ngama, M. Kellam, P. Cotten, M. Nokes, D. J.
Sci Rep, (2022). 12:202

Comparative performance of WANTAI ELISA for total immunoglobulin to receptor binding protein and an ELISA for IgG to spike protein in detecting SARS-CoV-2 antibodies in Kenyan populations.Nyagwange, J. Kutima, B. Mwai, K. Karanja, H. K. Gitonga, J. N. Mugo, D. Uyoga, S. Tuju, J. Ochola-Oyier, L. I. Ndungu, F. Bejon, P. Agweyu, A. Adetifa, I. M. O. Scott, J. A. G. Warimwe, G. M.
J Clin Virol, (2022). 146:105061

Spatial-temporal distribution and sequence diversity of group a human respiratory syncytial viruses in Kenya preceding the emergence of ON1 genotype.Wangui, J. Nokes, D. J. Mobegi, V. A. Otieno, J. R. Agoti, C. N. Ngeranwa, J. J. N. Bulimo, W. D.
Influenza Other Respir Viruses, (2022). 16:501-510

Malaria protection due to sickle haemoglobin depends on parasite genotype.Band, G. Leffler, E. M. Jallow, M. Sisay-Joof, F. Ndila, C. M. Macharia, A. W. Hubbart, C. Jeffreys, A. E. Rowlands, K. Nguyen, T. Goncalves, S. Ariani, C. V. Stalker, J. Pearson, R. D. Amato, R. Drury, E. Sirugo, G. d'Alessandro, U. Bojang, K. A. Marsh, K. Peshu, N. Saelens, J. W. Diakite, M. Taylor, S. M. Conway, D. J. Williams, T. N. Rockett, K. A. Kwiatkowski, D. P.
Nature, (2022). 602:106-111

Hepcidin regulation in Kenyan children with severe malaria and non-typhoidal Salmonella bacteremia.Abuga, K. M. Muriuki, J. M. Uyoga, S. M. Mwai, K. Makale, J. Mogire, R. M. Macharia, A. W. Mohammed, S. Muthumbi, E. Mwarumba, S. Mturi, N. Bejon, P. Scott, J. A. G. Nairz, M. Williams, T. N. Atkinson, S. H.
Haematologica, (2022). 107:1589-1598

Risk factors of anaemia and iron deficiency in Somali children and women: Findings from the 2019 Somalia Micronutrient Survey.Wirth, J. P. Sesay, F. Mbai, J. Ali, S. I. Donkor, W. E. S. Woodruff, B. A. Pilane, Z. Mohamud, K. M. Muse, A. Yussuf, H. O. Mohamed, W. S. Veraguth, R. Rezzi, S. Williams, T. N. Mohamoud, A. M. Mohamud, F. M. Galvin, M. Rohner, F. Katambo, Y. Petry, N.
Matern Child Nutr, (2022). 18:e13254

Seroprevalence of Antibodies to Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 Among Healthcare Workers in Kenya.Etyang, A. O. Lucinde, R. Karanja, H. Kalu, C. Mugo, D. Nyagwange, J. Gitonga, J. Tuju, J. Wanjiku, P. Karani, A. Mutua, S. Maroko, H. Nzomo, E. Maitha, E. Kamuri, E. Kaugiria, T. Weru, J. Ochola, L. B. Kilimo, N. Charo, S. Emukule, N. Moracha, W. Mukabi, D. Okuku, R. Ogutu, M. Angujo, B. Otiende, M. Bottomley, C. Otieno, E. Ndwiga, L. Nyaguara, A. Voller, S. Agoti, C. N. Nokes, D. J. Ochola-Oyier, L. I. Aman, R. Amoth, P. Mwangangi, M. Kasera, K. Ng'ang'a, W. Adetifa, I. M. O. Wangeci Kagucia, E. Gallagher, K. Uyoga, S. Tsofa, B. Barasa, E. Bejon, P. Scott, J. A. G. Agweyu, A. Warimwe, G. M.
Clin Infect Dis, (2022). 74:288-293

Mortality in rural coastal Kenya measured using the Kilifi Health and Demographic Surveillance System: a 16-year descriptive analysis.Otiende, M. Bauni, E. Nyaguara, A. Amadi, D. Nyundo, C. Tsory, E. Walumbe, D. Kinuthia, M. Kihuha, N. Kahindi, M. Nyutu, G. Moisi, J. Deribew, A. Agweyu, A. Marsh, K. Tsofa, B. Bejon, P. Bottomley, C. Williams, T. N. Scott, J. A. G.
Wellcome Open Res, (2021). 6:327

Children's Oxygen Administration Strategies And Nutrition Trial (COAST-Nutrition): a protocol for a phase II randomised controlled trial.Kiguli, S. Olopot-Olupot, P. Alaroker, F. Engoru, C. Opoka, R. O. Tagoola, A. Hamaluba, M. Mnjalla, H. Mpoya, A. Mogaka, C. Nalwanga, D. Nabawanuka, E. Nokes, J. Nyaigoti, C. Briend, A. van Woensel, J. B. M. Grieve, R. Sadique, Z. Williams, T. N. Thomas, K. Harrison, D. A. Rowan, K. Maitland, K.
Wellcome Open Res, (2021). 6:221

Individual's daily behaviour and intergenerational mixing in different social contexts of Kenya.Del Fava, E. Adema, I. Kiti, M. C. Poletti, P. Merler, S. Nokes, D. J. Manfredi, P. Melegaro, A.
Sci Rep, (2021). 11:21589

Quantifying previous SARS-CoV-2 infection through mixture modelling of antibody levels.Bottomley, C. Otiende, M. Uyoga, S. Gallagher, K. Kagucia, E. W. Etyang, A. O. Mugo, D. Gitonga, J. Karanja, H. Nyagwange, J. Adetifa, I. M. O. Agweyu, A. Nokes, D. J. Warimwe, G. M. Scott, J. A. G.
Nat Commun, (2021). 12:6196