Publications

Biosciences

Characterization of Anopheles gambiae D7 salivary proteins as markers of human-mosquito bite contact.Oseno, B. Marura, F. Ogwang, R. Muturi, M. Njunge, J. Nkumama, I. Mwakesi, R. Mwai, K. Rono, M. K. Mwakubambanya, R. Osier, F. Tuju, J.
Parasit Vectors, (2022). 15:11

Comparative performance of WANTAI ELISA for total immunoglobulin to receptor binding protein and an ELISA for IgG to spike protein in detecting SARS-CoV-2 antibodies in Kenyan populations.Nyagwange, J. Kutima, B. Mwai, K. Karanja, H. K. Gitonga, J. N. Mugo, D. Uyoga, S. Tuju, J. Ochola-Oyier, L. I. Ndungu, F. Bejon, P. Agweyu, A. Adetifa, I. M. O. Scott, J. A. G. Warimwe, G. M.
J Clin Virol, (2022). 146:105061

Malaria protection due to sickle haemoglobin depends on parasite genotype.Band, G. Leffler, E. M. Jallow, M. Sisay-Joof, F. Ndila, C. M. Macharia, A. W. Hubbart, C. Jeffreys, A. E. Rowlands, K. Nguyen, T. Goncalves, S. Ariani, C. V. Stalker, J. Pearson, R. D. Amato, R. Drury, E. Sirugo, G. d'Alessandro, U. Bojang, K. A. Marsh, K. Peshu, N. Saelens, J. W. Diakite, M. Taylor, S. M. Conway, D. J. Williams, T. N. Rockett, K. A. Kwiatkowski, D. P.
Nature, (2022). 602:106-111

Hepcidin regulation in Kenyan children with severe malaria and non-typhoidal Salmonella bacteremia.Abuga, K. M. Muriuki, J. M. Uyoga, S. M. Mwai, K. Makale, J. Mogire, R. M. Macharia, A. W. Mohammed, S. Muthumbi, E. Mwarumba, S. Mturi, N. Bejon, P. Scott, J. A. G. Nairz, M. Williams, T. N. Atkinson, S. H.
Haematologica, (2022). 107:1589-1598

Seroprevalence of Antibodies to Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 Among Healthcare Workers in Kenya.Etyang, A. O. Lucinde, R. Karanja, H. Kalu, C. Mugo, D. Nyagwange, J. Gitonga, J. Tuju, J. Wanjiku, P. Karani, A. Mutua, S. Maroko, H. Nzomo, E. Maitha, E. Kamuri, E. Kaugiria, T. Weru, J. Ochola, L. B. Kilimo, N. Charo, S. Emukule, N. Moracha, W. Mukabi, D. Okuku, R. Ogutu, M. Angujo, B. Otiende, M. Bottomley, C. Otieno, E. Ndwiga, L. Nyaguara, A. Voller, S. Agoti, C. N. Nokes, D. J. Ochola-Oyier, L. I. Aman, R. Amoth, P. Mwangangi, M. Kasera, K. Ng'ang'a, W. Adetifa, I. M. O. Wangeci Kagucia, E. Gallagher, K. Uyoga, S. Tsofa, B. Barasa, E. Bejon, P. Scott, J. A. G. Agweyu, A. Warimwe, G. M.
Clin Infect Dis, (2022). 74:288-293

Mortality in rural coastal Kenya measured using the Kilifi Health and Demographic Surveillance System: a 16-year descriptive analysis.Otiende, M. Bauni, E. Nyaguara, A. Amadi, D. Nyundo, C. Tsory, E. Walumbe, D. Kinuthia, M. Kihuha, N. Kahindi, M. Nyutu, G. Moisi, J. Deribew, A. Agweyu, A. Marsh, K. Tsofa, B. Bejon, P. Bottomley, C. Williams, T. N. Scott, J. A. G.
Wellcome Open Res, (2021). 6:327

Determinants of improvement trends in health workers' compliance with outpatient malaria case-management guidelines at health facilities with available "test and treat" commodities in Kenya.Amboko, B. Stepniewska, K. Malla, L. Machini, B. Bejon, P. Snow, R. W. Zurovac, D.
PLoS One, (2021). 16:e0259020

Quantifying previous SARS-CoV-2 infection through mixture modelling of antibody levels.Bottomley, C. Otiende, M. Uyoga, S. Gallagher, K. Kagucia, E. W. Etyang, A. O. Mugo, D. Gitonga, J. Karanja, H. Nyagwange, J. Adetifa, I. M. O. Agweyu, A. Nokes, D. J. Warimwe, G. M. Scott, J. A. G.
Nat Commun, (2021). 12:6196

Anti-Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 Immunoglobulin G Antibody Seroprevalence Among Truck Drivers and Assistants in Kenya.Kagucia, E. W. Gitonga, J. N. Kalu, C. Ochomo, E. Ochieng, B. Kuya, N. Karani, A. Nyagwange, J. Karia, B. Mugo, D. Karanja, H. K. Tuju, J. Mutiso, A. Maroko, H. Okubi, L. Maitha, E. Ajuck, H. Mukabi, D. Moracha, W. Bulimu, D. Andanje, N. Aman, R. Mwangangi, M. Amoth, P. Kasera, K. Ng'ang'a, W. Nyaguara, A. Voller, S. Otiende, M. Bottomley, C. Agoti, C. N. Ochola-Oyier, L. I. Adetifa, I. M. O. Etyang, A. O. Gallagher, K. E. Uyoga, S. Barasa, E. Bejon, P. Tsofa, B. Agweyu, A. Warimwe, G. M. Scott, J. A. G. Magarini Sub-County Tda Sars-CoV-2 Serosurveillance Team, The Busia County T. D. A. Sars-CoV-Serosurveillance Team
Open Forum Infect Dis, (2021). 8:ofab314

COVID-19 transmission dynamics underlying epidemic waves in Kenya.Brand, S. P. C. Ojal, J. Aziza, R. Were, V. Okiro, E. A. Kombe, I. K. Mburu, C. Ogero, M. Agweyu, A. Warimwe, G. M. Nyagwange, J. Karanja, H. Gitonga, J. N. Mugo, D. Uyoga, S. Adetifa, I. M. O. Scott, J. A. G. Otieno, E. Murunga, N. Otiende, M. Ochola-Oyier, L. I. Agoti, C. N. Githinji, G. Kasera, K. Amoth, P. Mwangangi, M. Aman, R. Ng'ang'a, W. Tsofa, B. Bejon, P. Keeling, M. J. Nokes, D. J. Barasa, E.
Science, (2021). 374:989-994

Assessing the Level and Determinants of COVID-19 Vaccine Confidence in Kenya.Orangi, S. Pinchoff, J. Mwanga, D. Abuya, T. Hamaluba, M. Warimwe, G. Austrian, K. Barasa, E.
Vaccines (Basel), (2021). 9:

Malaria infection and severe disease risks in Africa.Paton, R. S. Kamau, A. Akech, S. Agweyu, A. Ogero, M. Mwandawiro, C. Mturi, N. Mohammed, S. Mpimbaza, A. Kariuki, S. Otieno, N. A. Nyawanda, B. O. Mohamed, A. F. Mtove, G. Reyburn, H. Gupta, S. Bejon, P. Lourenco, J. Snow, R. W.
Science, (2021). 373:926-931

Equity for excellence in academic institutions: a manifesto for change.Wedekind, L. Noe, A. Mokaya, J. Tamandjou, C. Kapulu, M. Ruecker, A. Kestelyn, E. Zimba, M. Khatamzas, E. Eziefula, A. C. Mackintosh, C. L. Nascimento, R. Ariana, P. Best, D. Gibbs, E. Dunachie, S. Hadley, G. Ravenswood, H. Young, B. Kamau, C. Marsh, K. McShane, H. Hale, R. McPhilbin, E. Ovseiko, P. V. Oxford Equity in Academia, consortium Surender, R. Worland, C. White, L. J. Matthews, P. C.
Wellcome Open Res, (2021). 6:142

Tracking the introduction and spread of SARS-CoV-2 in coastal Kenya.Githinji, G. de Laurent, Z. R. Mohammed, K. S. Omuoyo, D. O. Macharia, P. M. Morobe, J. M. Otieno, E. Kinyanjui, S. M. Agweyu, A. Maitha, E. Kitole, B. Suleiman, T. Mwakinangu, M. Nyambu, J. Otieno, J. Salim, B. Kasera, K. Kiiru, J. Aman, R. Barasa, E. Warimwe, G. Bejon, P. Tsofa, B. Ochola-Oyier, L. I. Nokes, D. J. Agoti, C. N.
Nat Commun, (2021). 12:4809

Understanding the benefits and burdens associated with a malaria human infection study in Kenya: experiences of study volunteers and other stakeholders.Chi, P. C. Owino, E. A. Jao, I. Olewe, F. Ogutu, B. Bejon, P. Kapulu, M. Kamuya, D. Marsh, V. Chmi-Sika Study Team
Trials, (2021). 22:494

Improving statistical power in severe malaria genetic association studies by augmenting phenotypic precision.Watson, J. A. Ndila, C. M. Uyoga, S. Macharia, A. Nyutu, G. Mohammed, S. Ngetsa, C. Mturi, N. Peshu, N. Tsofa, B. Rockett, K. Leopold, S. Kingston, H. George, E. C. Maitland, K. Day, N. P. Dondorp, A. M. Bejon, P. Williams, T. N. Holmes, C. C. White, N. J.
Elife, (2021). 10:

Chronic Immune Activation and CD4(+) T Cell Lymphopenia in Healthy African Individuals: Perspectives for SARS-CoV-2 Vaccine Efficacy.Wolday, D. Ndungu, F. M. Gomez-Perez, G. P. de Wit, T. F. R.
Front Immunol, (2021). 12:693269

Temporal trends of SARS-CoV-2 seroprevalence during the first wave of the COVID-19 epidemic in Kenya.Adetifa, I. M. O. Uyoga, S. Gitonga, J. N. Mugo, D. Otiende, M. Nyagwange, J. Karanja, H. K. Tuju, J. Wanjiku, P. Aman, R. Mwangangi, M. Amoth, P. Kasera, K. Ng'ang'a, W. Rombo, C. Yegon, C. Kithi, K. Odhiambo, E. Rotich, T. Orgut, I. Kihara, S. Bottomley, C. Kagucia, E. W. Gallagher, K. E. Etyang, A. Voller, S. Lambe, T. Wright, D. Barasa, E. Tsofa, B. Bejon, P. Ochola-Oyier, L. I. Agweyu, A. Scott, J. A. G. Warimwe, G. M.
Nat Commun, (2021). 12:3966

Identifying prognostic factors of severe metabolic acidosis and uraemia in African children with severe falciparum malaria: a secondary analysis of a randomized trial.Mzumara, G. Leopold, S. Marsh, K. Dondorp, A. Ohuma, E. O. Mukaka, M.
Malar J, (2021). 20:282

The Plasmodium falciparum Rh5 invasion protein complex reveals an excess of rare variant mutations.Ndwiga, L. Osoti, V. Ochwedo, K. O. Wamae, K. Bejon, P. Rayner, J. C. Githinji, G. Ochola-Oyier, L. I.
Malar J, (2021). 20:278