Where do those data go? Reuse of screening results from clinical trials to estimate population prevalence of HBV infection in adults in Kilifi, Kenya.
Downs, L. O., Campbell, C., Abouyannis, M., Otiende, M., Kapulu, M., Obiero, C. W., Hamaluba, M., Ngetsa, C., Andersson, M. I., Githinji, G., Warimwe, G., Baisley, K., Scott, J. A. G., Matthews, P. C., Etyang, A.
J Virus Erad, (2023). 9:100355

Symptom prevalence and secondary attack rate of SARS-CoV-2 in rural Kenyan households: A prospective cohort study.
Gallagher, K. E., Nyiro, J., Agoti, C. N., Maitha, E., Nyagwange, J., Karani, A., Bottomley, C., Murunga, N., Githinji, G., Mutunga, M., Ochola-Oyier, L. I., Kombe, I., Nyaguara, A., Kagucia, E. W., Warimwe, G., Agweyu, A., Tsofa, B., Bejon, P., Scott, J. A. G., Nokes, D. J.
Influenza Other Respir Viruses, (2023). 17:e13185

New SARS-CoV-2 Omicron Variant with Spike Protein Mutation Y451H, Kilifi, Kenya, March-May 2023.
Mwanga, M. J., Lambisia, A. W., Morobe, J. M., Murunga, N., Moraa, E., Ndwiga, L., Cheruiyot, R., Musyoki, J., Mutunga, M., Guzman-Rincon, L. M., Sande, C., Mwangangi, J., Bejon, P., Ochola-Oyier, L. I., Nokes, D. J., Agoti, C. N., Nyiro, J., Githinji, G.
Emerg Infect Dis, (2023). 29:

A pan-African pathogen genomics data sharing platform to support disease outbreaks.
Christoffels, A., Mboowa, G., van Heusden, P., Makhubela, S., Githinji, G., Mwangi, S., Onywera, H., Nnaemeka, N., Amoako, D. G., Olawoye, I., Diallo, A., Mbala-Kingebeni, P., Oyola, S. O., Adu, B., Mvelase, C., Ondoa, P., Dratibi, F. A., Sow, A., Gumede, N., Tessema, S. K., Ouma, A. O., Tebeje, Y. K.
Nat Med, (2023). 29:1052-1055

Genomic epidemiology of human adenovirus F40 and F41 in coastal Kenya: A retrospective hospital-based surveillance study (2013-2022).
Lambisia, A. W., Makori, T. O., Mutunga, M., Cheruiyot, R., Murunga, N., Quick, J., Githinji, G., Nokes, D. J., Houldcroft, C. J., Agoti, C. N.
Virus Evol, (2023). 9:vead023

A systematic review of Hepatitis B virus (HBV) prevalence and genotypes in Kenya: Data to inform clinical care and health policy.
Downs, L. O., Campbell, C., Yonga, P., Githinji, G., Ansari, M. A., Matthews, P. C., Etyang, A. O.
PLOS Glob Public Health, (2023). 3:e0001165

Toward a global virus genomic surveillance network.
Hill, V., Githinji, G., Vogels, C. B. F., Bento, A. I., Chaguza, C., Carrington, C. V. F., Grubaugh, N. D.
Cell Host Microbe, (2023). S1931-3128:00107-5

Whole-genome sequencing of SARS-CoV-2 isolates from symptomatic and asymptomatic individuals in Tanzania.
Mziray, S. R., van Zwetselaar, M., Kayuki, C. C., Mbelele, P. M., Makubi, A. N., Magesa, A. S., Kisonga, R. M., Sonda, T. B., Kibiki, G. S., Githinji, G., Heysell, S. K., Chilongola, J. O., Mpagama, S. G.
Front Med (Lausanne), (2022). 9:1034682

Global disparities in SARS-CoV-2 genomic surveillance.
Brito, A. F., Semenova, E., Dudas, G., Hassler, G. W., Kalinich, C. C., Kraemer, M. U. G., Ho, J., Tegally, H., Githinji, G., Agoti, C. N., Matkin, L. E., Whittaker, C., Howden, B. P., Sintchenko, V., Zuckerman, N. S., Mor, O., Blankenship, H. M., de Oliveira, T., Lin, R. T. P., Siqueira, M. M., Resende, P. C., Vasconcelos, A. T. R., Spilki, F. R., Aguiar, R. S., Alexiev, I., Ivanov, I. N., Philipova, I., Carrington, C. V. F., Sahadeo, N. S. D., Branda, B., Gurry, C., Maurer-Stroh, S., Naidoo, D., von Eije, K. J., Perkins, M. D., van Kerkhove, M., Hill, S. C., Sabino, E. C., Pybus, O. G., Dye, C., Bhatt, S., Flaxman, S., Suchard, M. A., Grubaugh, N. D., Baele, G., Faria, N. R.
Nat Commun, (2022). 13:7003

The evolving SARS-CoV-2 epidemic in Africa: Insights from rapidly expanding genomic surveillance.
Tegally, H., San, J. E., Cotten, M., Moir, M., Tegomoh, B., Mboowa, G., Martin, D. P., Baxter, C., Lambisia, A. W., Diallo, A., Amoako, D. G., Diagne, M. M., Sisay, A., Zekri, A. N., Gueye, A. S., Sangare, A. K., Ouedraogo, A. S., Sow, A., Musa, A. O., Sesay, A. K., Abias, A. G., Elzagheid, A. I., Lagare, A., Kemi, A. S., Abar, A. E., Johnson, A. A., Fowotade, A., Oluwapelumi, A. O., Amuri, A. A., Juru, A., Kandeil, A., Mostafa, A., Rebai, A., Sayed, A., Kazeem, A., Balde, A., Christoffels, A., Trotter, A. J., Campbell, A., Keita, A. K., Kone, A., Bouzid, A., Souissi, A., Agweyu, A., Naguib, A., Gutierrez, A. V., Nkeshimana, A., Page, A. J., Yadouleton, A., Vinze, A., Happi, A. N., Chouikha, A., Iranzadeh, A., Maharaj, A., Batchi-Bouyou, A. L., Ismail, A., Sylverken, A. A., Goba, A., Femi, A., Sijuwola, A. E., Marycelin, B., Salako, B. L., Oderinde, B. S., Bolajoko, B., Diarra, B., Herring, B. L., Tsofa, B., Lekana-Douki, B., Mvula, B., Njanpop-Lafourcade, B. M., Marondera, B. T., Khaireh, B. A., Kouriba, B., Adu, B., Pool, B., McInnis, B., Brook, C., Williamson, C., Nduwimana, C., Anscombe, C., Pratt, C. B., Scheepers, C., Akoua-Koffi, C. G., Agoti, C. N., Mapanguy, C. M., Loucoubar, C., Onwuamah, C. K., Ihekweazu, C., Malaka, C. N., Peyrefitte, C., Grace, C., Omoruyi, C. E., Rafai, C. D., Morang'a, C. M., Erameh, C., Lule, D. B., Bridges, D. J., Mukadi-Bamuleka, D., Park, D., Rasmussen, D. A., Baker, D., Nokes, D. J., Ssemwanga, D., Tshiabuila, D., Amuzu, D. S. Y., Goedhals, D., Grant, D. S., Omuoyo, D. O., Maruapula, D., Wanjohi, D. W., Foster-Nyarko, E., Lusamaki, E. K., Simulundu, E., Ong'era, E. M., Ngabana, E. N., Abworo, E. O., Otieno, E., Shumba, E., Barasa, E., Ahmed, E. B., Ahmed, E. A., Lokilo, E., Mukantwari, E., Philomena, E., Belarbi, E., Simon-Loriere, E., Anoh, E. A., Manuel, E., Leendertz, F., Taweh, F. M., Wasfi, F., Abdelmoula, F., Takawira, F. T., Derrar, F., Ajogbasile, F. V., Treurnicht, F., Onikepe, F., Ntoumi, F., Muyembe, F. M., Ragomzingba, F. E. Z., Dratibi, F. A., Iyanu, F. A., Mbunsu, G. K., Thilliez, G., Kay, G. L., Akpede, G. O., van Zyl, G. U., Awandare, G. A., Kpeli, G. S., Schubert, G., Maphalala, G. P., Ranaivoson, H. C., Omunakwe, H. E., Onywera, H., Abe, H., Karray, H., Nansumba, H., Triki, H., Kadjo, H. A. A., Elgahzaly, H., Gumbo, H., Mathieu, H., Kavunga-Membo, H., Smeti, I., Olawoye, I. B., Adetifa, I. M. O., Odia, I., Ben Boubaker, I. B., Mohammad, I. A., Ssewanyana, I., Wurie, I., Konstantinus, I. S., Halatoko, J. W. A., Ayei, J., Sonoo, J., Makangara, J. C., Tamfum, J. M., Heraud, J. M., Shaffer, J. G., Giandhari, J., Musyoki, J., Nkurunziza, J., Uwanibe, J. N., Bhiman, J. N., Yasuda, J., Morais, J., Kiconco, J., Sandi, J. D., Huddleston, J., Odoom, J. K., Morobe, J. M., Gyapong, J. O., Kayiwa, J. T., Okolie, J. C., Xavier, J. S., Gyamfi, J., Wamala, J. F., Bonney, J. H. K., Nyandwi, J., Everatt, J., Nakaseegu, J., Ngoi, J. M., Namulondo, J., Oguzie, J. U., Andeko, J. C., Lutwama, J. J., Mogga, J. J. H., O'Grady, J., Siddle, K. J., Victoir, K., Adeyemi, K. T., Tumedi, K. A., Carvalho, K. S., Mohammed, K. S., Dellagi, K., Musonda, K. G., Duedu, K. O., Fki-Berrajah, L., Singh, L., Kepler, L. M., Biscornet, L., de Oliveira Martins, L., Chabuka, L., Olubayo, L., Ojok, L. D., Deng, L. L., Ochola-Oyier, L. I., Tyers, L., Mine, M., Ramuth, M., Mastouri, M., ElHefnawi, M., Mbanne, M., Matsheka, M. I., Kebabonye, M., Diop, M., Momoh, M., Lima Mendonca, M. D. L., Venter, M., Paye, M. F., Faye, M., Nyaga, M. M., Mareka, M., Damaris, M. M., Mburu, M. W., Mpina, M. G., Owusu, M., Wiley, M. R., Tatfeng, M. Y., Ayekaba, M. O., Abouelhoda, M., Beloufa, M. A., Seadawy, M. G., Khalifa, M. K., Matobo, M. M., Kane, M., Salou, M., Mbulawa, M. B., Mwenda, M., Allam, M., Phan, M. V. T., Abid, N., Rujeni, N., Abuzaid, N., Ismael, N., Elguindy, N., Top, N. M., Dia, N., Mabunda, N., Hsiao, N. Y., Silochi, N. B., Francisco, N. M., Saasa, N., Bbosa, N., Murunga, N., Gumede, N., Wolter, N., Sitharam, N., Ndodo, N., Ajayi, N. A., Tordo, N., Mbhele, N., Razanajatovo, N. H., Iguosadolo, N., Mba, N., Kingsley, O. C., Sylvanus, O., Femi, O., Adewumi, O. M., Testimony, O., Ogunsanya, O. A., Fakayode, O., Ogah, O. E., Oludayo, O. E., Faye, O., Smith-Lawrence, P., Ondoa, P., Combe, P., Nabisubi, P., Semanda, P., Oluniyi, P. E., Arnaldo, P., Quashie, P. K., Okokhere, P. O., Bejon, P., Dussart, P., Bester, P. A., Mbala, P. K., Kaleebu, P., Abechi, P., El-Shesheny, R., Joseph, R., Aziz, R. K., Essomba, R. G., Ayivor-Djanie, R., Njouom, R., Phillips, R. O., Gorman, R., Kingsley, R. A., Neto Rodrigues, R. M. D. E. S. A., Audu, R. A., Carr, R. A. A., Gargouri, S., Masmoudi, S., Bootsma, S., Sankhe, S., Mohamed, S. I., Femi, S., Mhalla, S., Hosch, S., Kassim, S. K., Metha, S., Trabelsi, S., Agwa, S. H., Mwangi, S. W., Doumbia, S., Makiala-Mandanda, S., Aryeetey, S., Ahmed, S. S., Ahmed, S. M., Elhamoumi, S., Moyo, S., Lutucuta, S., Gaseitsiwe, S., Jalloh, S., Andriamandimby, S. F., Oguntope, S., Grayo, S., Lekana-Douki, S., Prosolek, S., Ouangraoua, S., van Wyk, S., Schaffner, S. F., Kanyerezi, S., Ahuka-Mundeke, S., Rudder, S., Pillay, S., Nabadda, S., Behillil, S., Budiaki, S. L., van der Werf, S., Mashe, T., Mohale, T., Le-Viet, T., Velavan, T. P., Schindler, T., Maponga, T. G., Bedford, T., Anyaneji, U. J., Chinedu, U., Ramphal, U., George, U. E., Enouf, V., Nene, V., Gorova, V., Roshdy, W. H., Karim, W. A., Ampofo, W. K., Preiser, W., Choga, W. T., Ahmed, Y. A., Ramphal, Y., Bediako, Y., Naidoo, Y., Butera, Y., de Laurent, Z. R., Africa Pathogen Genomics, Initiative., Ouma, A. E. O., von Gottberg, A., Githinji, G., Moeti, M., Tomori, O., Sabeti, P. C., Sall, A. A., Oyola, S. O., Tebeje, Y. K., Tessema, S. K., de Oliveira, T., Happi, C., Lessells, R., Nkengasong, J., Wilkinson, E.
Science, (2022). :eabq5358