pubtest

Publications

Epidemiology and Demography

Genome Sequences of Human Coronavirus OC43 and NL63, Associated with Respiratory Infections in Kilifi, Kenya.Kamau, E. Luka, M. M. de Laurent, Z. R. Adema, I. Agoti, C. N. Nokes, D. J.
Microbiol Resour Announc, (2019). 8:

Exploring Plasmodium falciparum Var Gene Expression to Assess Host Selection Pressure on Parasites During Infancy.Kivisi, C. A. Muthui, M. Hunt, M. Fegan, G. Otto, T. D. Githinji, G. Warimwe, G. M. Rance, R. Marsh, K. Bull, P. C. Abdi, A. I.
Front Immunol, (2019). 10:2328

Transfusion Timing and Volume in African Children with Severe Anemia. Reply.Maitland, K. Olupot-Olupot, P. Walker, A. S.
N Engl J Med, (2019). 381:1687-1688

Informing thresholds for paediatric transfusion in Africa: the need for a trial.Maitland, K. Ohuma, E. O. Mpoya, A. Uyoga, S. Hassall, O. Williams, T. N.
Wellcome Open Res, (2019). 4:27

IgM in human immunity to Plasmodium falciparum malaria.Boyle, M. J. Chan, J. A. Handayuni, I. Reiling, L. Feng, G. Hilton, A. Kurtovic, L. Oyong, D. Piera, K. A. Barber, B. E. William, T. Eisen, D. P. Minigo, G. Langer, C. Drew, D. R. de Labastida Rivera, F. Amante, F. H. Williams, T. N. Kinyanjui, S. Marsh, K. Doolan, D. L. Engwerda, C. Fowkes, F. J. I. Grigg, M. J. Mueller, I. McCarthy, J. S. Anstey, N. M. Beeson, J. G.
Sci Adv, (2019). 5:eaax4489

Risk factors for death among children aged 5-14 years hospitalised with pneumonia: a retrospective cohort study in Kenya.Macpherson, L. Ogero, M. Akech, S. Aluvaala, J. Gathara, D. Irimu, G. English, M. Agweyu, A.
BMJ Glob Health, (2019). 4:e001715

Co-trimoxazole or multivitamin multimineral supplement for post-discharge outcomes after severe anaemia in African children: a randomised controlled trial.Maitland, K. Olupot-Olupot, P. Kiguli, S. Chagaluka, G. Alaroker, F. Opoka, R. O. Mpoya, A. Walsh, K. Engoru, C. Nteziyaremye, J. Mallewa, M. Kennedy, N. Nakuya, M. Namayanja, C. Kayaga, J. Nabawanuka, E. Sennyondo, T. Aromut, D. Kumwenda, F. Musika, C. W. Thomason, M. J. Bates, I. von Hensbroek, M. B. Evans, J. A. Uyoga, S. Williams, T. N. Frost, G. George, E. C. Gibb, D. M. Walker, A. S. Tract trial group
Lancet Glob Health, (2019). 7:e1435-e1447

The ferroportin Q248H mutation protects from anemia, but not malaria or bacteremia.Muriuki, J. M. Mentzer, A. J. Band, G. Gilchrist, J. J. Carstensen, T. Lule, S. A. Goheen, M. M. Joof, F. Kimita, W. Mogire, R. Cutland, C. L. Diarra, A. Rautanen, A. Pomilla, C. Gurdasani, D. Rockett, K. Mturi, N. Ndungu, F. M. Scott, J. A. G. Sirima, S. B. Morovat, A. Prentice, A. M. Madhi, S. A. Webb, E. L. Elliott, A. M. Bejon, P. Sandhu, M. S. Hill, A. V. S. Kwiatkowski, D. P. Williams, T. N. Cerami, C. Atkinson, S. H.
Sci Adv, (2019). 5:eaaw0109

Study design and protocol for investigating social network patterns in rural and urban schools and households in a coastal setting in Kenya using wearable proximity sensors.Kiti, M. C. Melegaro, A. Cattuto, C. Nokes, D. J.
Wellcome Open Res, (2019). 4:84

Human metapneumovirus prevalence and patterns of subgroup persistence identified through surveillance of pediatric pneumonia hospital admissions in coastal Kenya, 2007-2016.Oketch, J. W. Kamau, E. Otieno, G. P. Otieno, J. R. Agoti, C. N. Nokes, D. J.
BMC Infect Dis, (2019). 19:757

The epidemiology of sickle cell disease in children recruited in infancy in Kilifi, Kenya: a prospective cohort study.Uyoga, S. Macharia, A. W. Mochamah, G. Ndila, C. M. Nyutu, G. Makale, J. Tendwa, M. Nyatichi, E. Ojal, J. Otiende, M. Shebe, M. Awuondo, K. O. Mturi, N. Peshu, N. Tsofa, B. Maitland, K. Scott, J. A. G. Williams, T. N.
Lancet Glob Health, (2019). 7:e1458-e1466

Transfusion Volume for Children with Severe Anemia in Africa.Maitland, K. Olupot-Olupot, P. Kiguli, S. Chagaluka, G. Alaroker, F. Opoka, R. O. Mpoya, A. Engoru, C. Nteziyaremye, J. Mallewa, M. Kennedy, N. Nakuya, M. Namayanja, C. Kayaga, J. Uyoga, S. Kyeyune Byabazaire, D. M'Baya, B. Wabwire, B. Frost, G. Bates, I. Evans, J. A. Williams, T. N. Saramago Goncalves, P. George, E. C. Gibb, D. M. Walker, A. S. Tract Group
N Engl J Med, (2019). 381:420-431

Immediate Transfusion in African Children with Uncomplicated Severe Anemia.Maitland, K. Kiguli, S. Olupot-Olupot, P. Engoru, C. Mallewa, M. Saramago Goncalves, P. Opoka, R. O. Mpoya, A. Alaroker, F. Nteziyaremye, J. Chagaluka, G. Kennedy, N. Nabawanuka, E. Nakuya, M. Namayanja, C. Uyoga, S. Kyeyune Byabazaire, D. M'Baya, B. Wabwire, B. Frost, G. Bates, I. Evans, J. A. Williams, T. N. George, E. C. Gibb, D. M. Walker, A. S. Tract Group
N Engl J Med, (2019). 381:407-419

Author Correction: Airway response to respiratory syncytial virus has incidental antibacterial effects.Sande, C. J. Njunge, J. M. Ngoi, J. M. Mutunga, M. N. Chege, T. Gicheru, E. T. Gardiner, E. M. Gwela, A. Green, C. A. Drysdale, S. B. Berkley, J. A. Nokes, D. J. Pollard, A. J.
Nat Commun, (2019). 10:3291

Genomic analysis of respiratory syncytial virus infections in households and utility in inferring who infects the infant.Agoti, C. N. Phan, M. V. T. Munywoki, P. K. Githinji, G. Medley, G. F. Cane, P. A. Kellam, P. Cotten, M. Nokes, D. J.
Sci Rep, (2019). 9:10076

Observational study: 27 years of severe malaria surveillance in Kilifi, Kenya.Njuguna, P. Maitland, K. Nyaguara, A. Mwanga, D. Mogeni, P. Mturi, N. Mohammed, S. Mwambingu, G. Ngetsa, C. Awuondo, K. Lowe, B. Adetifa, I. Scott, J. A. G. Williams, T. N. Atkinson, S. Osier, F. Snow, R. W. Marsh, K. Tsofa, B. Peshu, N. Hamaluba, M. Berkley, J. A. Newton, C. R. J. Fondo, J. Omar, A. Bejon, P.
BMC Med, (2019). 17:124

Scalable Workflows and Reproducible Data Analysis for Genomics.Strozzi, F. Janssen, R. Wurmus, R. Crusoe, M. R. Githinji, G. Di Tommaso, P. Belhachemi, D. Moller, S. Smant, G. de Ligt, J. Prins, P.
Methods Mol Biol, (2019). 1910:723-745

Gastroenteritis aggressive versus slow treatment for rehydration (GASTRO): a phase II rehydration trial for severe dehydration: WHO plan C versus slow rehydration.Houston, K. A. Gibb, J. Olupot-Olupot, P. Obonyo, N. Mpoya, A. Nakuya, M. Muhindo, R. Uyoga, S. Evans, J. A. Connon, R. Gibb, D. M. George, E. C. Maitland, K.
BMC Med, (2019). 17:122

Gametocyte carriage in an era of changing malaria epidemiology: A 19-year analysis of a malaria longitudinal cohort.Muthui, M. K. Mogeni, P. Mwai, K. Nyundo, C. Macharia, A. Williams, T. N. Nyangweso, G. Wambua, J. Mwanga, D. Marsh, K. Bejon, P. Kapulu, M. C.
Wellcome Open Res, (2019). 4:66

Effect of strikes by health workers on mortality between 2010 and 2016 in Kilifi, Kenya: a population-based cohort analysis.Ong'ayo, G. Ooko, M. Wang'ondu, R. Bottomley, C. Nyaguara, A. Tsofa, B. K. Williams, T. N. Bejon, P. Scott, J. A. G. Etyang, A. O.
Lancet Glob Health, (2019). 7:e961-e967