James Nyagwange

A natural experiment in Kenya reveals durable immunosuppressive effects of early childhood malaria: a longitudinal cohort study.Safari, M. S. Makori, T. O. Gicheru, E. T. Mburu, M. W. Nyawa, O. K. Shee, F. M. Nyagwange, J. Kagucia, E. W. Ndungu, F. M. Kuria, T. C. Tuju, J. O. Sande, C. J.
Elife, (2026). 14:

Comparison of capillary microsampling and venous blood for multi-pathogen serosurveillance.Ombati, R. Kimani, M. Akech, D. Kutima, B. Sigilai, A. K. Karia, B. Osoti, V. Karani, A. Ziraba, A. Bigogo, G. Munywoki, P. Scott, J. A. G. Agweyu, A. Kagucia, E. W. Nyagwange, J.
Sci Rep, (2026). :

Longitudinal evidence of differential pertussis antibody durability following natural infection among vaccinated children living in contrasting malaria transmission settings in coastal Kenya.Safari, M. S. Gicheru, E. T. Mburu, M. W. Makori, T. O. Nyawa, O. Odoyo, S. O. Shee, F. Ndungu, F. Foley, D. J. Nyagwange, J. Chege, T. Sande, C. J.
Vaccine, (2026). 88:128837

Heart-nosed bat alphacoronaviruses use human CEACAM6 to enter cells.Gallo, G. Di Nardo, A. Lugano, D. Roberts, A. J. Kutima, B. A. Okombo, M. Dewantari, A. K. Buckley, F. M. M. Wright, G. J. Nyagwange, J. Agwanda, B. Graham, S. C. Bailey, D.
Nature, (2026). 653:180-189

Longitudinal Epidemiology and Variant Dynamics of SARS-CoV-2 in Coastal Kenya (2020-2025): Clinical Features and Wave Patterns.Lambisia, A. W. Nyiro, J. Githinji, G. Katama, E. N. Moraa, E. Mwita, J. M. Mutunga, M. Maina, G. Bejon, P. Phan, M. V. T. Cotten, M. Dellicour, S. Ochola-Oyier, L. I. Sande, C. Holmes, E. C. Nyagwange, J. Agoti, C. N.
Open Forum Infect Dis, (2026). 13:ofag084

Assessing the Impact of SARS-CoV-2 Spike Mutations on Antibody Binding: A Comparative Assessment of the Wuhan and JN.1 Variants' Full-Length Spikes in a Multiplex Luminex Assay.Waweru, G. Nyakundi, R. Kutima, B. Owuor, S. Konyino, G. Gitonga, J. Lugano, D. Maina, A. Musyoki, J. Ochola, L. Omondi, M. Kariuki, C. K. Ogongo, P. Mwachari, C. Shee, F. Agoti, C. Sande, C. Uyoga, S. Kagucia, E. Agweyu, A. Bejon, P. Scott, J. A. G. Warimwe, G. M. Ochola-Oyier, L. I. Nyagwange, J.
Viruses, (2025). 17:

Genomic and clinical epidemiology of SARS-CoV-2 in coastal Kenya: insights into variant circulation, reinfection, and multiple lineage importations during a post-pandemic wave.Lambisia, A. W. Katama, E. N. Moraa, E. Mwita, J. M. Gallagher, K. Mutunga, M. Nyale, E. Omungala, J. Mwanga, M. Murunga, N. Nyiro, J. Nyagwange, J. Sande, C. Bejon, P. Githinji, G. Dellicour, S. Phan, M. V. T. Cotten, M. Ochola-Oyier, L. I. Holmes, E. C. Agoti, C. N.
BMC Glob Public Health, (2025). 3:80

Comparative performance of the InBios SCoV-2 Detect (TM) IgG ELISA and the in-house KWTRP ELISA in detecting SARS-CoV-2 spike IgG antibodies in Kenyan populations.Kutima, B. Kagucia, E. W. Mwai, K. Kimani, M. Sigilai, A. Mugo, D. Karanja, H. Gitonga, J. N. Karani, A. Akech, D. Toroitich, M. Karia, B. Tuju, J. Ziraba, A. K. Bigogo, G. Ochieng, C. Onyango, C. Lidechi, S. Munywoki, P. K. Uyoga, S. Adetifa, I. M. O. Oyier, L. I. O. Bejon, P. Scott, J. A. G. Agweyu, A. Warimwe, G. M. Nyagwange, J. Kenya, Sars-CoV-Serology Consortium
Wellcome Open Res, (2024). 9:349

Profile: The Kenya Multi-Site Serosurveillance (KEMIS) collaboration.Kagucia, E. W. Voller, S. Ziraba, A. K. Bigogo, G. Munywoki, P. K. Makobu, K. Nokes, D. J. Nyagwange, J. Orlendo, C. Akech, D. Sigilai, A. Onyango, C. Juma, B. Herman-Roloff, A. Munyua, P. Apondi, C. Lidechi, S. Audi, A. Ouma, A. Aol, G. Misore, T. Nasimiyu, C. Onyango, D. Lo, T. Kasera, K. Jalang'o, R. Kingwara, L. Adetifa, I. Etyang, A. O. Warimwe, G. Agweyu, A. Scott, J. A. G.
Gates Open Res, (2024). 8:60

Evaluation of population immunity against SARS-CoV-2 variants, EG.5.1, FY.4, BA.2.86, JN.1, JN.1.4, and KP.3.1.1 using samples from two health demographic surveillance systems in Kenya.Lugano, D. Kutima, B. Kimani, M. Sigilai, A. Gitonga, J. Karani, A. Akech, D. Karia, B. Ziraba, A. K. Maina, A. Lambisia, A. Omuoyo, D. Mugo, D. Lucinde, R. Owuor, S. Konyino, G. Newman, J. Bailey, D. Nduati, E. Githinji, G. Agoti, C. N. Bejon, P. Scott, J. A. G. Agweyu, A. Kagucia, W. Warimwe, G. M. Sande, C. Ochola-Oyier, L. I. Nyagwange, J.
BMC Infect Dis, (2024). 24:1474

Kinetics of naturally induced binding and neutralising anti-SARS-CoV-2 antibody levels and potencies among SARS-CoV-2 infected Kenyans with diverse grades of COVID-19 severity: an observational study.Kimotho, J. Sein, Y. Sayed, S. Shah, R. Mwai, K. Saleh, M. Wanjiku, P. Mwacharo, J. Nyagwange, J. Karanja, H. Kutima, B. Gitonga, J. N. Mugo, D. Karanu, A. Moranga, L. Oluoch, V. Shah, J. Mutiso, J. Mburu, A. Nneka, Z. Betti, P. Usyu Mutinda, W. Issak Abdi, A. Bejon, P. Isabella Ochola-Oyier, L. M. Warimwe G Nduati, E. W. M. Ndungu F
Wellcome Open Res, (2023). 8:350

Safety and immunogenicity of ChAdOx1 nCoV-19 (AZD1222) vaccine in adults in Kenya: a phase 1/2 single-blind, randomised controlled trial.Hamaluba, M. Sang, S. Orindi, B. Njau, I. Karanja, H. Kamau, N. Gitonga, J. N. Mugo, D. Wright, D. Nyagwange, J. Kutima, B. Omuoyo, D. Mwatasa, M. Ngetsa, C. Agoti, C. Cheruiyot, S. Nyaguara, A. Munene, M. Mturi, N. Oloo, E. Ochola-Oyier, L. Mumba, N. Mauncho, C. Namayi, R. Davies, A. Tsofa, B. Nduati, E. W. Aliyan, N. Kasera, K. Etyang, A. Boyd, A. Hill, A. Gilbert, S. Douglas, A. Pollard, A. Bejon, P. Lambe, T. Warimwe, G. C. O. V. Vaccine Trial Group
Wellcome Open Res, (2023). 8:182

Symptom prevalence and secondary attack rate of SARS-CoV-2 in rural Kenyan households: A prospective cohort study.Gallagher, K. E. Nyiro, J. Agoti, C. N. Maitha, E. Nyagwange, J. Karani, A. Bottomley, C. Murunga, N. Githinji, G. Mutunga, M. Ochola-Oyier, L. I. Kombe, I. Nyaguara, A. Kagucia, E. W. Warimwe, G. Agweyu, A. Tsofa, B. Bejon, P. Scott, J. A. G. Nokes, D. J.
Influenza Other Respir Viruses, (2023). 17:e13185

SARS-CoV-2 seroprevalence and implications for population immunity: Evidence from two Health and Demographic Surveillance System sites in Kenya, February-December 2022.Kagucia, E. W. Ziraba, A. K. Nyagwange, J. Kutima, B. Kimani, M. Akech, D. Ng'oda, M. Sigilai, A. Mugo, D. Karanja, H. Gitonga, J. Karani, A. Toroitich, M. Karia, B. Otiende, M. Njeri, A. Aman, R. Amoth, P. Mwangangi, M. Kasera, K. Ng'ang'a, W. Voller, S. Ochola-Oyier, L. I. Bottomley, C. Nyaguara, A. Munywoki, P. K. Bigogo, G. Maitha, E. Uyoga, S. Gallagher, K. E. Etyang, A. O. Barasa, E. Mwangangi, J. Bejon, P. Adetifa, I. M. O. Warimwe, G. M. Scott, J. A. G. Agweyu, A.
Influenza Other Respir Viruses, (2023). 17:e13173

A Customizable Suite of Methods to Sequence and Annotate Cattle Antibodies.Ramirez Valdez, K. Nzau, B. Dorey-Robinson, D. Jarman, M. Nyagwange, J. Schwartz, J. C. Freimanis, G. Steyn, A. W. Warimwe, G. M. Morrison, L. J. Mwangi, W. Charleston, B. Bonnet-Di Placido, M. Hammond, J. A.
Vaccines (Basel), (2023). 11:

Serum immunoglobulin G and mucosal immunoglobulin A antibodies from prepandemic samples collected in Kilifi, Kenya, neutralize SARS-CoV-2 in vitro.Nyagwange, J. Kutima, B. Mwai, K. Karanja, H. K. Gitonga, J. N. Mugo, D. Sein, Y. Wright, D. Omuoyo, D. O. Nyiro, J. U. Tuju, J. Nokes, D. J. Agweyu, A. Bejon, P. Ochola-Oyier, L. I. Scott, J. A. G. Lambe, T. Nduati, E. Agoti, C. Warimwe, G. M.
Int J Infect Dis, (2023). 127:11-16

SARS-CoV-2 seroprevalence in three Kenyan health and demographic surveillance sites, December 2020-May 2021.Etyang, A. O. Adetifa, I. Omore, R. Misore, T. Ziraba, A. K. Ng'oda, M. A. Gitau, E. Gitonga, J. Mugo, D. Kutima, B. Karanja, H. Toroitich, M. Nyagwange, J. Tuju, J. Wanjiku, P. Aman, R. Amoth, P. Mwangangi, M. Kasera, K. Ng'ang'a, W. Akech, D. Sigilai, A. Karia, B. Karani, A. Voller, S. Agoti, C. N. Ochola-Oyier, L. I. Otiende, M. Bottomley, C. Nyaguara, A. Uyoga, S. Gallagher, K. Kagucia, E. W. Onyango, D. Tsofa, B. Mwangangi, J. Maitha, E. Barasa, E. Bejon, P. Warimwe, G. M. Scott, J. A. G. Agweyu, A.
PLOS Glob Public Health, (2022). 2:e0000883

Sero-surveillance for IgG to SARS-CoV-2 at antenatal care clinics in three Kenyan referral hospitals: Repeated cross-sectional surveys 2020-21.Lucinde, R. K. Mugo, D. Bottomley, C. Karani, A. Gardiner, E. Aziza, R. Gitonga, J. N. Karanja, H. Nyagwange, J. Tuju, J. Wanjiku, P. Nzomo, E. Kamuri, E. Thuranira, K. Agunda, S. Nyutu, G. Etyang, A. O. Adetifa, I. M. O. Kagucia, E. Uyoga, S. Otiende, M. Otieno, E. Ndwiga, L. Agoti, C. N. Aman, R. A. Mwangangi, M. Amoth, P. Kasera, K. Nyaguara, A. Ng'ang'a, W. Ochola, L. B. Namdala, E. Gaunya, O. Okuku, R. Barasa, E. Bejon, P. Tsofa, B. Ochola-Oyier, L. I. Warimwe, G. M. Agweyu, A. Scott, J. A. G. Gallagher, K. E.
PLoS One, (2022). 17:e0265478

Epidemiology of COVID-19 infections on routine polymerase chain reaction (PCR) and serology testing in Coastal Kenya.Nyagwange, J. Ndwiga, L. Muteru, K. Wamae, K. Tuju, J. Testing Team, C. Kutima, B. Gitonga, J. Karanja, H. Mugo, D. Kasera, K. Amoth, P. Murunga, N. Babu, L. Otieno, E. Githinji, G. Nokes, D. J. Tsofa, B. Orindi, B. Barasa, E. Warimwe, G. Agoti, C. N. Bejon, P. Ochola-Oyier, L. I.
Wellcome Open Res, (2022). 7:69

Comparative performance of WANTAI ELISA for total immunoglobulin to receptor binding protein and an ELISA for IgG to spike protein in detecting SARS-CoV-2 antibodies in Kenyan populations.Nyagwange, J. Kutima, B. Mwai, K. Karanja, H. K. Gitonga, J. N. Mugo, D. Uyoga, S. Tuju, J. Ochola-Oyier, L. I. Ndungu, F. Bejon, P. Agweyu, A. Adetifa, I. M. O. Scott, J. A. G. Warimwe, G. M.
J Clin Virol, (2022). 146:105061