Publications

Biosciences

Epidemiological impact and cost-effectiveness analysis of COVID-19 vaccination in Kenya.Orangi, S. Ojal, J. Brand, S. P. Orlendo, C. Kairu, A. Aziza, R. Ogero, M. Agweyu, A. Warimwe, G. M. Uyoga, S. Otieno, E. Ochola-Oyier, L. I. Agoti, C. N. Kasera, K. Amoth, P. Mwangangi, M. Aman, R. Ng'ang'a, W. Adetifa, I. M. Scott, J. A. G. Bejon, P. Keeling, M. J. Flasche, S. Nokes, D. J. Barasa, E.
BMJ Glob Health, (2022). 7:

Improving the diagnosis of severe malaria in African children using platelet counts and plasma PfHRP2 concentrations.Watson, J. A. Uyoga, S. Wanjiku, P. Makale, J. Nyutu, G. M. Mturi, N. George, E. C. Woodrow, C. J. Day, N. P. J. Bejon, P. Opoka, R. O. Dondorp, A. M. John, C. C. Maitland, K. Williams, T. N. White, N. J.
Sci Transl Med, (2022). 14:eabn5040

Phagocytosis of Plasmodium falciparum ring-stage parasites predicts protection against malaria.Musasia, F. K. Nkumama, I. N. Frank, R. Kipkemboi, V. Schneider, M. Mwai, K. Odera, D. O. Rosenkranz, M. Fürle, K. Kimani, D. Tuju, J. Njuguna, P. Hamaluba, M. Kapulu, M. C. Wardemann, H. Abdi, A. I. Abebe, Y. Bejon, P. Billingsley, P. F. Bull, P. C. de Laurent, Z. Hoffman, S. L. James, E. R. Kariuki, S. Kimathi, R. Kinyanjui, S. Kivisi, C. Makale, J. Marsh, K. Mohammed, K. S. Mosobo, M. Musembi, J. Musyoki, J. Muthui, M. Mwacharo, J. Ndungu, F. Ngoi, J. M. Ngoto, O. Ogutu, B. Olewe, F. Omuoyo, D. Ong’echa, J. Otieno, E. Shangala, J. Sim, B. K. L. Richie, T. L. Wambua, J. Williams, T. N. Osier, F. H. A.
Nature Communications, (2022). 13:4098

Genomic Epidemiology of SARS-CoV-2 in Seychelles, 2020-2021.Morobe, J. M. Pool, B. Marie, L. Didon, D. Lambisia, A. W. Makori, T. Mohammed, K. S. de Laurent, Z. R. Ndwiga, L. Mburu, M. W. Moraa, E. Murunga, N. Musyoki, J. Mwacharo, J. Nyamako, L. Riako, D. Ephnatus, P. Gambo, F. Naimani, J. Namulondo, J. Tembo, S. Z. Ogendi, E. Balde, T. Dratibi, F. A. Yahaya, A. A. Gumede, N. Achilla, R. A. Borus, P. K. Wanjohi, D. W. Tessema, S. K. Mwangangi, J. Bejon, P. Nokes, D. J. Ochola-Oyier, L. I. Githinji, G. Biscornet, L. Agoti, C. N.
Viruses, (2022). 14:

Maintenance of high temporal Plasmodium falciparum genetic diversity and complexity of infection in asymptomatic and symptomatic infections in Kilifi, Kenya from 2007 to 2018.Kimenyi, K. M. Wamae, K. Ngoi, J. M. de Laurent, Z. R. Ndwiga, L. Osoti, V. Obiero, G. Abdi, A. I. Bejon, P. Ochola-Oyier, L. I.
Malar J, (2022). 21:192

Breadth of Antibodies to Plasmodium falciparum Variant Surface Antigens Is Associated With Immunity in a Controlled Human Malaria Infection Study.Kimingi, H. W. Kinyua, A. W. Achieng, N. A. Wambui, K. M. Mwangi, S. Nguti, R. Kivisi, C. A. Jensen, A. T. R. Bejon, P. Kapulu, M. C. Abdi, A. I. Kinyanjui, S. M. Chmi-Sika Study Team
Front Immunol, (2022). 13:894770

Transmission networks of SARS-CoV-2 in Coastal Kenya during the first two waves: A retrospective genomic study.Agoti, C. N. Ochola-Oyier, L. I. Dellicour, S. Mohammed, K. S. Lambisia, A. W. de Laurent, Z. R. Morobe, J. M. Mburu, M. W. Omuoyo, D. O. Ongera, E. M. Ndwiga, L. Maitha, E. Kitole, B. Suleiman, T. Mwakinangu, M. Nyambu, J. K. Otieno, J. Salim, B. Musyoki, J. Murunga, N. Otieno, E. Kiiru, J. N. Kasera, K. Amoth, P. Mwangangi, M. Aman, R. Kinyanjui, S. Warimwe, G. Phan, M. Agweyu, A. Cotten, M. Barasa, E. Tsofa, B. Nokes, D. J. Bejon, P. Githinji, G.
Elife, (2022). 11:

Undertaking Community Engagement for a Controlled Human Malaria Infection Study in Kenya: Approaches and Lessons Learnt.Mumba, N. Njuguna, P. Chi, P. Marsh, V. Awuor, E. Hamaluba, M. Mauncho, C. Mwalukore, S. Masha, J. Mwangoma, M. Kalama, B. Alphan, H. Wambua, J. Bejon, P. Kamuya, D. Kapulu, M. C.
Front Public Health, (2022). 10:793913

Incidence of chikungunya virus infections among Kenyan children with neurological disease, 2014-2018: A cohort study.Nyamwaya, D. K. Otiende, M. Mwango, L. Kariuki, S. M. Otieno, B. Omuoyo, D. O. Githinji, G. Kitsao, B. S. Karanja, H. K. Gitonga, J. N. de Laurent, Z. R. Davies, A. Mwarumba, S. Agoti, C. N. Thumbi, S. M. Hamaluba, M. M. Newton, C. R. Bejon, P. Warimwe, G. M.
PLoS Med, (2022). 19:e1003994

Transcriptomic signatures induced by the Ebola virus vaccine rVSVDeltaG-ZEBOV-GP in adult cohorts in Europe, Africa, and North America: a molecular biomarker study.Vianello, E. Gonzalez-Dias, P. van Veen, S. Engele, C. G. Quinten, E. Monath, T. P. Medaglini, D. Vsv-Ebovac Consortium Vsv-Eboplus Consortium Santoro, F. Huttner, A. Dubey, S. Eichberg, M. Ndungu, F. M. Kremsner, P. G. Essone, P. N. Agnandji, S. T. Siegrist, C. A. Nakaya, H. I. Ottenhoff, T. H. M. Haks, M. C.
Lancet Microbe, (2022). 3:e113-e123

Epidemiology of COVID-19 infections on routine polymerase chain reaction (PCR) and serology testing in Coastal Kenya.Nyagwange, J. Ndwiga, L. Muteru, K. Wamae, K. Tuju, J. Testing Team, C. Kutima, B. Gitonga, J. Karanja, H. Mugo, D. Kasera, K. Amoth, P. Murunga, N. Babu, L. Otieno, E. Githinji, G. Nokes, D. J. Tsofa, B. Orindi, B. Barasa, E. Warimwe, G. Agoti, C. N. Bejon, P. Ochola-Oyier, L. I.
Wellcome Open Res, (2022). 7:69

Cessation of exclusive breastfeeding and seasonality, but not small intestinal bacterial overgrowth, are associated with environmental enteric dysfunction: A birth cohort study amongst infants in rural Kenya.Crane, R. J. Parker, E. P. K. Fleming, S. Gwela, A. Gumbi, W. Ngoi, J. M. de Laurent, Z. R. Nyatichi, E. Ngari, M. Wambua, J. Uhlig, H. H. Berkley, J. A.
EClinicalMedicine, (2022). 47:101403

Ethical considerations around volunteer payments in a malaria human infection study in Kenya: an embedded empirical ethics study.Chi, P. C. Owino, E. A. Jao, I. Bejon, P. Kapulu, M. Marsh, V. Kamuya, D.
BMC Med Ethics, (2022). 23:46

Amplicon Sequencing as a Potential Surveillance Tool for Complexity of Infection and Drug Resistance Markers in Plasmodium falciparum Asymptomatic Infections.Wamae, K. Kimenyi, K. M. Osoti, V. de Laurent, Z. R. Ndwiga, L. Kharabora, O. Hathaway, N. J. Bailey, J. A. Juliano, J. J. Bejon, P. Ochola-Oyier, L. I.
J Infect Dis, (2022). 226:920-927

Long-lasting insecticide-treated net use and malaria infections on the Kenyan coast.Kamau, A. Musau, M. Mtanje, G. Mataza, C. Bejon, P. Snow, R. W.
Trans R Soc Trop Med Hyg, (2022). 116:966-970

Vitamin D Deficiency and Its Association with Iron Deficiency in African Children.Mogire, R. M. Muriuki, J. M. Morovat, A. Mentzer, A. J. Webb, E. L. Kimita, W. Ndungu, F. M. Macharia, A. W. Cutland, C. L. Sirima, S. B. Diarra, A. Tiono, A. B. Lule, S. A. Madhi, S. A. Prentice, A. M. Bejon, P. Pettifor, J. M. Elliott, A. M. Adeyemo, A. Williams, T. N. Atkinson, S. H.
Nutrients, (2022). 14:

TRUE-1: Trial of Repurposed Unithiol for snakebite Envenoming phase 1 (safety, tolerability, pharmacokinetics and pharmacodynamics in healthy Kenyan adults).Abouyannis, M. FitzGerald, R. Ngama, M. Mwangudzah, H. Nyambura, Y. K. Ngome, S. Riako, D. Babu, L. Lewa, F. Else, L. Dily Penchala, S. Orindi, B. Mumba, N. Kalama, B. Ndungu, F. M. Adetifa, I. Khoo, S. Lalloo, D. G. Casewell, N. R. Hamaluba, M.
Wellcome Open Res, (2022). 7:90

Plasmodium falciparum-Specific Memory B-Cell and Antibody Responses Are Associated With Immunity in Children Living in an Endemic Area of Kenya.Jahnmatz, P. Nyabundi, D. Sundling, C. Widman, L. Mwacharo, J. Musyoki, J. Otieno, E. Ahlborg, N. Bejon, P. Ndungu, F. M. Farnert, A.
Front Immunol, (2022). 13:799306

Clinical manifestations of Rift Valley fever in humans: Systematic review and meta-analysis.Anywaine, Z. Lule, S. A. Hansen, C. Warimwe, G. Elliott, A.
PLoS Negl Trop Dis, (2022). 16:e0010233

Targeted Amplicon Deep Sequencing for Monitoring Antimalarial Resistance Markers in Western Kenya.Osoti, V. Akinyi, M. Wamae, K. Kimenyi, K. M. de Laurent, Z. Ndwiga, L. Gichuki, P. Okoyo, C. Kepha, S. Mwandawiro, C. Kandie, R. Bejon, P. Snow, R. W. Ochola-Oyier, L. I.
Antimicrob Agents Chemother, (2022). 66:e0194521