Publications
Biosciences
847 results
A cross-sectional analysis identifies a low prevalence of Plasmodium ovale species infections in symptomatic and asymptomatic individuals in Kilifi county, Kenya.Akinyi, M. Y.
Chifwete, M.
Ndwiga, L.
Kimenyi, K. M.
Osoti, V.
Ochola-Oyier, L. I.
Wellcome Open Res, (2022). 7:207
The CINAMR (Clinical Information Network-Antimicrobial Resistance) Project: A pilot microbial surveillance using hospitals linked to regional laboratories in Kenya: Study Protocol.Akech, S.
Nyamwaya, B.
Gachoki, J.
Ogero, M.
Kigo, J.
Maina, M.
Mutua, E.
Ooko, E.
Bejon, P.
Mwarumba, S.
Bahati, F.
Mvera, B.
Musyimi, R.
Onsare, R.
Hutter, J.
Tanui, E.
Wesangula, E.
Turner, P.
Dunachie, S.
Lucey, O.
McKnight, J.
Cinamr Investigators
Wellcome Open Res, (2022). 7:256
Targeted amplicon deep sequencing of ama1 and mdr1 to track within-host P. falciparum diversity throughout treatment in a clinical drug trial.Wamae, K.
Ndwiga, L.
Kharabora, O.
Kimenyi, K.
Osoti, V.
de Laurent, Z.
Wambua, J.
Musyoki, J.
Ngetsa, C.
Kalume, P.
Mwambingu, G.
Hamaluba, M.
van der Pluijm, R.
Dondorp, A. M.
Bailey, J.
Juliano, J.
Bejon, P.
Ochola-Oyier, L.
Wellcome Open Res, (2022). 7:95
SARS-CoV-2 seroprevalence in three Kenyan health and demographic surveillance sites, December 2020-May 2021.Etyang, A. O.
Adetifa, I.
Omore, R.
Misore, T.
Ziraba, A. K.
Ng'oda, M. A.
Gitau, E.
Gitonga, J.
Mugo, D.
Kutima, B.
Karanja, H.
Toroitich, M.
Nyagwange, J.
Tuju, J.
Wanjiku, P.
Aman, R.
Amoth, P.
Mwangangi, M.
Kasera, K.
Ng'ang'a, W.
Akech, D.
Sigilai, A.
Karia, B.
Karani, A.
Voller, S.
Agoti, C. N.
Ochola-Oyier, L. I.
Otiende, M.
Bottomley, C.
Nyaguara, A.
Uyoga, S.
Gallagher, K.
Kagucia, E. W.
Onyango, D.
Tsofa, B.
Mwangangi, J.
Maitha, E.
Barasa, E.
Bejon, P.
Warimwe, G. M.
Scott, J. A. G.
Agweyu, A.
PLOS Glob Public Health, (2022). 2:e0000883
The global burden of Chikungunya fever among children: A systematic literature review and meta-analysis.Nyamwaya, D. K.
Thumbi, S. M.
Bejon, P.
Warimwe, G. M.
Mokaya, J.
PLOS Glob Public Health, (2022). 2:e0000914
The effect of malaria on childhood anemia in a quasi-experimental study of 7,384 twins from 23 Sub-Saharan African countries.Starck, T.
Dambach, P.
Rouamba, T.
Tinto, H.
Osier, F.
Oldenburg, C. E.
Adam, M.
Barnighausen, T.
Jaenisch, T.
Bulstra, C. A.
Front Public Health, (2022). 10:1009865
Assessment of a diverse panel of transmitted/founder HIV-1 infectious molecular clones in a luciferase based CD8 T-cell mediated viral inhibition assay.Fernandez, N.
Hayes, P.
Makinde, J.
Hare, J.
King, D.
Xu, R.
Rehawi, O.
Mezzell, A. T.
Kato, L.
Mugaba, S.
Serwanga, J.
Chemweno, J.
Nduati, E.
Price, M. A.
Osier, F.
Ochsenbauer, C.
Yue, L.
Hunter, E.
Gilmour, J.
Iavi protocol C investigators
Front Immunol, (2022). 13:1029029
Vectorial capacity and TEP1 genotypes of Anopheles gambiae sensu lato mosquitoes on the Kenyan coast.Bartilol, B.
Omuoyo, D.
Karisa, J.
Ominde, K.
Mbogo, C.
Mwangangi, J.
Maia, M.
Rono, M. K.
Parasit Vectors, (2022). 15:448
Malaria vector bionomics in Taita-Taveta County, coastal Kenya.Karisa, J.
Ominde, K.
Muriu, S.
Munyao, V.
Mwikali, K.
Babu, L.
Ondieki, Z.
Bartilol, B.
Tuwei, M.
Wanjiku, C.
Maia, M.
Midega, J.
Rono, M.
Peshu, N.
Mbogo, C.
Mwangangi, J. M.
Parasit Vectors, (2022). 15:430
Malaria attributable fractions with changing transmission intensity: Bayesian latent class vs logistic models.Mwai, K.
Nkumama, I.
Thairu, A.
Mburu, J.
Odera, D.
Kimathi, R.
Nyamako, L.
Tuju, J.
Kinyanjui, S.
Musenge, E.
Osier, F.
Malar J, (2022). 21:326
Asplenia and spleen hypofunction.Lenti, M. V.
Luu, S.
Carsetti, R.
Osier, F.
Ogwang, R.
Nnodu, O. E.
Wiedermann, U.
Spencer, J.
Locatelli, F.
Corazza, G. R.
Di Sabatino, A.
Nat Rev Dis Primers, (2022). 8:71
Sero-surveillance for IgG to SARS-CoV-2 at antenatal care clinics in three Kenyan referral hospitals: Repeated cross-sectional surveys 2020-21.Lucinde, R. K.
Mugo, D.
Bottomley, C.
Karani, A.
Gardiner, E.
Aziza, R.
Gitonga, J. N.
Karanja, H.
Nyagwange, J.
Tuju, J.
Wanjiku, P.
Nzomo, E.
Kamuri, E.
Thuranira, K.
Agunda, S.
Nyutu, G.
Etyang, A. O.
Adetifa, I. M. O.
Kagucia, E.
Uyoga, S.
Otiende, M.
Otieno, E.
Ndwiga, L.
Agoti, C. N.
Aman, R. A.
Mwangangi, M.
Amoth, P.
Kasera, K.
Nyaguara, A.
Ng'ang'a, W.
Ochola, L. B.
Namdala, E.
Gaunya, O.
Okuku, R.
Barasa, E.
Bejon, P.
Tsofa, B.
Ochola-Oyier, L. I.
Warimwe, G. M.
Agweyu, A.
Scott, J. A. G.
Gallagher, K. E.
PLoS One, (2022). 17:e0265478
Complement-mediated serum bactericidal activity of antibodies elicited by the Shigella sonnei GMMA vaccine in adults from a shigellosis-endemic country: Exploratory analysis of a Phase 2a randomized study.Kapulu, M. C.
Nakakana, U.
Scire, A. S.
Sarakinou, E.
Conti, V.
Rossi, O.
Acquaviva, A.
Necchi, F.
Obiero, C. W.
Martin, L. B.
Bejon, P.
Njuguna, P.
Micoli, F.
Podda, A.
Front Immunol, (2022). 13:971866
Revealing the extent of the first wave of the COVID-19 pandemic in Kenya based on serological and PCR-test data.Ojal, J.
Brand, S. P. C.
Were, V.
Okiro, E. A.
Kombe, I. K.
Mburu, C.
Aziza, R.
Ogero, M.
Agweyu, A.
Warimwe, G. M.
Uyoga, S.
Adetifa, I. M. O.
Scott, J. A. G.
Otieno, E.
Ochola-Oyier, L. I.
Agoti, C. N.
Kasera, K.
Amoth, P.
Mwangangi, M.
Aman, R.
Ng'ang'a, W.
Tsofa, B.
Bejon, P.
Barasa, E.
Keeling, M. J.
Nokes, D. J.
Wellcome Open Res, (2022). 6:127
The evolving SARS-CoV-2 epidemic in Africa: Insights from rapidly expanding genomic surveillance.Tegally, H.
San, J. E.
Cotten, M.
Moir, M.
Tegomoh, B.
Mboowa, G.
Martin, D. P.
Baxter, C.
Lambisia, A. W.
Diallo, A.
Amoako, D. G.
Diagne, M. M.
Sisay, A.
Zekri, A. N.
Gueye, A. S.
Sangare, A. K.
Ouedraogo, A. S.
Sow, A.
Musa, A. O.
Sesay, A. K.
Abias, A. G.
Elzagheid, A. I.
Lagare, A.
Kemi, A. S.
Abar, A. E.
Johnson, A. A.
Fowotade, A.
Oluwapelumi, A. O.
Amuri, A. A.
Juru, A.
Kandeil, A.
Mostafa, A.
Rebai, A.
Sayed, A.
Kazeem, A.
Balde, A.
Christoffels, A.
Trotter, A. J.
Campbell, A.
Keita, A. K.
Kone, A.
Bouzid, A.
Souissi, A.
Agweyu, A.
Naguib, A.
Gutierrez, A. V.
Nkeshimana, A.
Page, A. J.
Yadouleton, A.
Vinze, A.
Happi, A. N.
Chouikha, A.
Iranzadeh, A.
Maharaj, A.
Batchi-Bouyou, A. L.
Ismail, A.
Sylverken, A. A.
Goba, A.
Femi, A.
Sijuwola, A. E.
Marycelin, B.
Salako, B. L.
Oderinde, B. S.
Bolajoko, B.
Diarra, B.
Herring, B. L.
Tsofa, B.
Lekana-Douki, B.
Mvula, B.
Njanpop-Lafourcade, B. M.
Marondera, B. T.
Khaireh, B. A.
Kouriba, B.
Adu, B.
Pool, B.
McInnis, B.
Brook, C.
Williamson, C.
Nduwimana, C.
Anscombe, C.
Pratt, C. B.
Scheepers, C.
Akoua-Koffi, C. G.
Agoti, C. N.
Mapanguy, C. M.
Loucoubar, C.
Onwuamah, C. K.
Ihekweazu, C.
Malaka, C. N.
Peyrefitte, C.
Grace, C.
Omoruyi, C. E.
Rafai, C. D.
Morang'a, C. M.
Erameh, C.
Lule, D. B.
Bridges, D. J.
Mukadi-Bamuleka, D.
Park, D.
Rasmussen, D. A.
Baker, D.
Nokes, D. J.
Ssemwanga, D.
Tshiabuila, D.
Amuzu, D. S. Y.
Goedhals, D.
Grant, D. S.
Omuoyo, D. O.
Maruapula, D.
Wanjohi, D. W.
Foster-Nyarko, E.
Lusamaki, E. K.
Simulundu, E.
Ong'era, E. M.
Ngabana, E. N.
Abworo, E. O.
Otieno, E.
Shumba, E.
Barasa, E.
Ahmed, E. B.
Ahmed, E. A.
Lokilo, E.
Mukantwari, E.
Philomena, E.
Belarbi, E.
Simon-Loriere, E.
Anoh, E. A.
Manuel, E.
Leendertz, F.
Taweh, F. M.
Wasfi, F.
Abdelmoula, F.
Takawira, F. T.
Derrar, F.
Ajogbasile, F. V.
Treurnicht, F.
Onikepe, F.
Ntoumi, F.
Muyembe, F. M.
Ragomzingba, F. E. Z.
Dratibi, F. A.
Iyanu, F. A.
Mbunsu, G. K.
Thilliez, G.
Kay, G. L.
Akpede, G. O.
van Zyl, G. U.
Awandare, G. A.
Kpeli, G. S.
Schubert, G.
Maphalala, G. P.
Ranaivoson, H. C.
Omunakwe, H. E.
Onywera, H.
Abe, H.
Karray, H.
Nansumba, H.
Triki, H.
Kadjo, H. A. A.
Elgahzaly, H.
Gumbo, H.
Mathieu, H.
Kavunga-Membo, H.
Smeti, I.
Olawoye, I. B.
Adetifa, I. M. O.
Odia, I.
Ben Boubaker, I. B.
Muhammad, I. A.
Ssewanyana, I.
Wurie, I.
Konstantinus, I. S.
Halatoko, J. W. A.
Ayei, J.
Sonoo, J.
Makangara, J. C.
Tamfum, J. M.
Heraud, J. M.
Shaffer, J. G.
Giandhari, J.
Musyoki, J.
Nkurunziza, J.
Uwanibe, J. N.
Bhiman, J. N.
Yasuda, J.
Morais, J.
Kiconco, J.
Sandi, J. D.
Huddleston, J.
Odoom, J. K.
Morobe, J. M.
Gyapong, J. O.
Kayiwa, J. T.
Okolie, J. C.
Xavier, J. S.
Gyamfi, J.
Wamala, J. F.
Bonney, J. H. K.
Nyandwi, J.
Everatt, J.
Nakaseegu, J.
Ngoi, J. M.
Namulondo, J.
Oguzie, J. U.
Andeko, J. C.
Lutwama, J. J.
Mogga, J. J. H.
O'Grady, J.
Siddle, K. J.
Victoir, K.
Adeyemi, K. T.
Tumedi, K. A.
Carvalho, K. S.
Mohammed, K. S.
Dellagi, K.
Musonda, K. G.
Duedu, K. O.
Fki-Berrajah, L.
Singh, L.
Kepler, L. M.
Biscornet, L.
de Oliveira Martins, L.
Chabuka, L.
Olubayo, L.
Ojok, L. D.
Deng, L. L.
Ochola-Oyier, L. I.
Tyers, L.
Mine, M.
Ramuth, M.
Mastouri, M.
ElHefnawi, M.
Mbanne, M.
Matsheka, M. I.
Kebabonye, M.
Diop, M.
Momoh, M.
Lima Mendonca, M. D. L.
Venter, M.
Paye, M. F.
Faye, M.
Nyaga, M. M.
Mareka, M.
Damaris, M. M.
Mburu, M. W.
Mpina, M. G.
Owusu, M.
Wiley, M. R.
Tatfeng, M. Y.
Ayekaba, M. O.
Abouelhoda, M.
Beloufa, M. A.
Seadawy, M. G.
Khalifa, M. K.
Matobo, M. M.
Kane, M.
Salou, M.
Mbulawa, M. B.
Mwenda, M.
Allam, M.
Phan, M. V. T.
Abid, N.
Rujeni, N.
Abuzaid, N.
Ismael, N.
Elguindy, N.
Top, N. M.
Dia, N.
Mabunda, N.
Hsiao, N. Y.
Silochi, N. B.
Francisco, N. M.
Saasa, N.
Bbosa, N.
Murunga, N.
Gumede, N.
Wolter, N.
Sitharam, N.
Ndodo, N.
Ajayi, N. A.
Tordo, N.
Mbhele, N.
Razanajatovo, N. H.
Iguosadolo, N.
Mba, N.
Kingsley, O. C.
Sylvanus, O.
Femi, O.
Adewumi, O. M.
Testimony, O.
Ogunsanya, O. A.
Fakayode, O.
Ogah, O. E.
Oludayo, O. E.
Faye, O.
Smith-Lawrence, P.
Ondoa, P.
Combe, P.
Nabisubi, P.
Semanda, P.
Oluniyi, P. E.
Arnaldo, P.
Quashie, P. K.
Okokhere, P. O.
Bejon, P.
Dussart, P.
Bester, P. A.
Mbala, P. K.
Kaleebu, P.
Abechi, P.
El-Shesheny, R.
Joseph, R.
Aziz, R. K.
Essomba, R. G.
Ayivor-Djanie, R.
Njouom, R.
Phillips, R. O.
Gorman, R.
Kingsley, R. A.
Neto Rodrigues, Rmdesa
Audu, R. A.
Carr, R. A. A.
Gargouri, S.
Masmoudi, S.
Bootsma, S.
Sankhe, S.
Mohamed, S. I.
Femi, S.
Mhalla, S.
Hosch, S.
Kassim, S. K.
Metha, S.
Trabelsi, S.
Agwa, S. H.
Mwangi, S. W.
Doumbia, S.
Makiala-Mandanda, S.
Aryeetey, S.
Ahmed, S. S.
Ahmed, S. M.
Elhamoumi, S.
Moyo, S.
Lutucuta, S.
Gaseitsiwe, S.
Jalloh, S.
Andriamandimby, S. F.
Oguntope, S.
Grayo, S.
Lekana-Douki, S.
Prosolek, S.
Ouangraoua, S.
van Wyk, S.
Schaffner, S. F.
Kanyerezi, S.
Ahuka-Mundeke, S.
Rudder, S.
Pillay, S.
Nabadda, S.
Behillil, S.
Budiaki, S. L.
van der Werf, S.
Mashe, T.
Mohale, T.
Le-Viet, T.
Velavan, T. P.
Schindler, T.
Maponga, T. G.
Bedford, T.
Anyaneji, U. J.
Chinedu, U.
Ramphal, U.
George, U. E.
Enouf, V.
Nene, V.
Gorova, V.
Roshdy, W. H.
Karim, W. A.
Ampofo, W. K.
Preiser, W.
Choga, W. T.
Ahmed, Y. A.
Ramphal, Y.
Bediako, Y.
Naidoo, Y.
Butera, Y.
de Laurent, Z. R.
Africa Pathogen Genomics Initiative double, dagger
Ouma, A. E. O.
von Gottberg, A.
Githinji, G.
Moeti, M.
Tomori, O.
Sabeti, P. C.
Sall, A. A.
Oyola, S. O.
Tebeje, Y. K.
Tessema, S. K.
de Oliveira, T.
Happi, C.
Lessells, R.
Nkengasong, J.
Wilkinson, E.
Science, (2022). 378:eabq5358
Epidemiological impact and cost-effectiveness analysis of COVID-19 vaccination in Kenya.Orangi, S.
Ojal, J.
Brand, S. P.
Orlendo, C.
Kairu, A.
Aziza, R.
Ogero, M.
Agweyu, A.
Warimwe, G. M.
Uyoga, S.
Otieno, E.
Ochola-Oyier, L. I.
Agoti, C. N.
Kasera, K.
Amoth, P.
Mwangangi, M.
Aman, R.
Ng'ang'a, W.
Adetifa, I. M.
Scott, J. A. G.
Bejon, P.
Keeling, M. J.
Flasche, S.
Nokes, D. J.
Barasa, E.
BMJ Glob Health, (2022). 7:
Improving the diagnosis of severe malaria in African children using platelet counts and plasma PfHRP2 concentrations.Watson, J. A.
Uyoga, S.
Wanjiku, P.
Makale, J.
Nyutu, G. M.
Mturi, N.
George, E. C.
Woodrow, C. J.
Day, N. P. J.
Bejon, P.
Opoka, R. O.
Dondorp, A. M.
John, C. C.
Maitland, K.
Williams, T. N.
White, N. J.
Sci Transl Med, (2022). 14:eabn5040
Phagocytosis of Plasmodium falciparum ring-stage parasites predicts protection against malaria.Musasia, F. K.
Nkumama, I. N.
Frank, R.
Kipkemboi, V.
Schneider, M.
Mwai, K.
Odera, D. O.
Rosenkranz, M.
F├╝rle, K.
Kimani, D.
Tuju, J.
Njuguna, P.
Hamaluba, M.
Kapulu, M. C.
Wardemann, H.
Abdi, A. I.
Abebe, Y.
Bejon, P.
Billingsley, P. F.
Bull, P. C.
de Laurent, Z.
Hoffman, S. L.
James, E. R.
Kariuki, S.
Kimathi, R.
Kinyanjui, S.
Kivisi, C.
Makale, J.
Marsh, K.
Mohammed, K. S.
Mosobo, M.
Musembi, J.
Musyoki, J.
Muthui, M.
Mwacharo, J.
Ndungu, F.
Ngoi, J. M.
Ngoto, O.
Ogutu, B.
Olewe, F.
Omuoyo, D.
OngÔÇÖecha, J.
Otieno, E.
Shangala, J.
Sim, B. K. L.
Richie, T. L.
Wambua, J.
Williams, T. N.
Osier, F. H. A.
Nature Communications, (2022). 13:4098
Genomic Epidemiology of SARS-CoV-2 in Seychelles, 2020-2021.Morobe, J. M.
Pool, B.
Marie, L.
Didon, D.
Lambisia, A. W.
Makori, T.
Mohammed, K. S.
de Laurent, Z. R.
Ndwiga, L.
Mburu, M. W.
Moraa, E.
Murunga, N.
Musyoki, J.
Mwacharo, J.
Nyamako, L.
Riako, D.
Ephnatus, P.
Gambo, F.
Naimani, J.
Namulondo, J.
Tembo, S. Z.
Ogendi, E.
Balde, T.
Dratibi, F. A.
Yahaya, A. A.
Gumede, N.
Achilla, R. A.
Borus, P. K.
Wanjohi, D. W.
Tessema, S. K.
Mwangangi, J.
Bejon, P.
Nokes, D. J.
Ochola-Oyier, L. I.
Githinji, G.
Biscornet, L.
Agoti, C. N.
Viruses, (2022). 14:
Maintenance of high temporal Plasmodium falciparum genetic diversity and complexity of infection in asymptomatic and symptomatic infections in Kilifi, Kenya from 2007 to 2018.Kimenyi, K. M.
Wamae, K.
Ngoi, J. M.
de Laurent, Z. R.
Ndwiga, L.
Osoti, V.
Obiero, G.
Abdi, A. I.
Bejon, P.
Ochola-Oyier, L. I.
Malar J, (2022). 21:192