Publications

Epidemiology and Demography

Cause-specific mortality in Africa and Asia: evidence from INDEPTH health and demographic surveillance system sites.Streatfield, P. K. Khan, W. A. Bhuiya, A. Alam, N. Sie, A. Soura, A. B. Bonfoh, B. Ngoran, E. K. Weldearegawi, B. Jasseh, M. Oduro, A. Gyapong, M. Kant, S. Juvekar, S. Wilopo, S. Williams, T. N. Odhiambo, F. O. Beguy, D. Ezeh, A. Kyobutungi, C. Crampin, A. Delaunay, V. Tollman, S. M. Herbst, K. Chuc, N. T. Sankoh, O. A. Tanner, M. Byass, P.
Glob Health Action, (2014). 7:25362

Accuracy of clinical stroke scores for distinguishing stroke subtypes in resource poor settings: A systematic review of diagnostic test accuracy.Mwita, C. C. Kajia, D. Gwer, S. Etyang, A. Newton, C. R.
J Neurosci Rural Pract, (2014). 5:330-9

An assessment of the impact of host polymorphisms on Plasmodium falciparum var gene expression patterns among Kenyan children.Warimwe, G. M. Fegan, G. Kiragu, E. W. Musyoki, J. N. Macharia, A. W. Marsh, K. Williams, T. N. Bull, P. C.
BMC Infect Dis, (2014). 14:524

Genetic determinants of glucose-6-phosphate dehydrogenase activity in Kenya.Shah, S. S. Macharia, A. Makale, J. Uyoga, S. Kivinen, K. Craik, R. Hubbart, C. Wellems, T. E. Rockett, K. A. Kwiatkowski, D. P. Williams, T. N.
BMC Med Genet, (2014). 15:93

Prevalence and correlates of treatment failure among Kenyan children hospitalised with severe community-acquired pneumonia: a prospective study of the clinical effectiveness of WHO pneumonia case management guidelines.Agweyu, A. Kibore, M. Digolo, L. Kosgei, C. Maina, V. Mugane, S. Muma, S. Wachira, J. Waiyego, M. Maleche-Obimbo, E.
Trop Med Int Health, (2014). 19:1310-20

Quantifying age-related rates of social contact using diaries in a rural coastal population of Kenya.Kiti, M. C. Kinyanjui, T. M. Koech, D. C. Munywoki, P. K. Medley, G. F. Nokes, D. J.
PLoS One, (2014). 9:e104786

Knowing who to trust: exploring the role of 'ethical metadata' in mediating risk of harm in collaborative genomics research in Africa.de Vries, J. Williams, T. N. Bojang, K. Kwiatkowski, D. P. Fitzpatrick, R. Parker, M.
BMC Med Ethics, (2014). 15:62

Population effect of 10-valent pneumococcal conjugate vaccine on nasopharyngeal carriage of Streptococcus pneumoniae and non-typeable Haemophilus influenzae in Kilifi, Kenya: findings from cross-sectional carriage studies.Hammitt, L. L. Akech, D. O. Morpeth, S. C. Karani, A. Kihuha, N. Nyongesa, S. Bwanaali, T. Mumbo, E. Kamau, T. Sharif, S. K. Scott, J. A.
Lancet Glob Health, (2014). 2:e397-405

Global, regional, and national incidence and mortality for HIV, tuberculosis, and malaria during 1990-2013: a systematic analysis for the Global Burden of Disease Study 2013.Murray, C. J. Ortblad, K. F. Guinovart, C. Lim, S. S. Wolock, T. M. Roberts, D. A. Dansereau, E. A. Graetz, N. Barber, R. M. Brown, J. C. Wang, H. Duber, H. C. Naghavi, M. Dicker, D. Dandona, L. Salomon, J. A. Heuton, K. R. Foreman, K. Phillips, D. E. Fleming, T. D. Flaxman, A. D. Phillips, B. K. Johnson, E. K. Coggeshall, M. S. Abd-Allah, F. Abera, S. F. Abraham, J. P. Abubakar, I. Abu-Raddad, L. J. Abu-Rmeileh, N. M. Achoki, T. Adeyemo, A. O. Adou, A. K. Adsuar, J. C. Agardh, E. E. Akena, D. Al Kahbouri, M. J. Alasfoor, D. Albittar, M. I. Alcala-Cerra, G. Alegretti, M. A. Alemu, Z. A. Alfonso-Cristancho, R. Alhabib, S. Ali, R. Alla, F. Allen, P. J. Alsharif, U. Alvarez, E. Alvis-Guzman, N. Amankwaa, A. A. Amare, A. T. Amini, H. Ammar, W. Anderson, B. O. Antonio, C. A. Anwari, P. Arnlov, J. Arsenijevic, V. S. Artaman, A. Asghar, R. J. Assadi, R. Atkins, L. S. Badawi, A. Balakrishnan, K. Banerjee, A. Basu, S. Beardsley, J. Bekele, T. Bell, M. L. Bernabe, E. Beyene, T. J. Bhala, N. Bhalla, A. Bhutta, Z. A. Abdulhak, A. B. Binagwaho, A. Blore, J. D. Basara, B. B. Bose, D. Brainin, M. Breitborde, N. Castaneda-Orjuela, C. A. Catala-Lopez, F. Chadha, V. K. Chang, J. C. Chiang, P. P. Chuang, T. W. Colomar, M. Cooper, L. T. Cooper, C. Courville, K. J. Cowie, B. C. Criqui, M. H. Dandona, R. Dayama, A. De Leo, D. Degenhardt, L. Del Pozo-Cruz, B. Deribe, K. Des Jarlais, D. C. Dessalegn, M. Dharmaratne, S. D. Dilmen, U. Ding, E. L. Driscoll, T. R. Durrani, A. M. Ellenbogen, R. G. Ermakov, S. P. Esteghamati, A. Faraon, E. J. Farzadfar, F. Fereshtehnejad, S. M. Fijabi, D. O. Forouzanfar, M. H. Fra Paleo, U. Gaffikin, L. Gamkrelidze, A. Gankpe, F. G. Geleijnse, J. M. Gessner, B. D. Gibney, K. B. Ginawi, I. A. Glaser, E. L. Gona, P. Goto, A. Gouda, H. N. Gugnani, H. C. Gupta, R. Gupta, R. Hafezi-Nejad, N. Hamadeh, R. R. Hammami, M. Hankey, G. J. Harb, H. L. Haro, J. M. Havmoeller, R. Hay, S. I. Hedayati, M. T. Pi, I. B. Hoek, H. W. Hornberger, J. C. Hosgood, H. D. Hotez, P. J. Hoy, D. G. Huang, J. J. Iburg, K. M. Idrisov, B. T. Innos, K. Jacobsen, K. H. Jeemon, P. Jensen, P. N. Jha, V. Jiang, G. Jonas, J. B. Juel, K. Kan, H. Kankindi, I. Karam, N. E. Karch, A. Karema, C. K. Kaul, A. Kawakami, N. Kazi, D. S. Kemp, A. H. Kengne, A. P. Keren, A. Kereselidze, M. Khader, Y. S. Khalifa, S. E. Khan, E. A. Khang, Y. H. Khonelidze, I. Kinfu, Y. Kinge, J. M. Knibbs, L. Kokubo, Y. Kosen, S. Defo, B. K. Kulkarni, V. S. Kulkarni, C. Kumar, K. Kumar, R. B. Kumar, G. A. Kwan, G. F. Lai, T. Balaji, A. L. Lam, H. Lan, Q. Lansingh, V. C. Larson, H. J. Larsson, A. Lee, J. T. Leigh, J. Leinsalu, M. Leung, R. Li, Y. Li, Y. De Lima, G. M. Lin, H. H. Lipshultz, S. E. Liu, S. Liu, Y. Lloyd, B. K. Lotufo, P. A. Machado, V. M. Maclachlan, J. H. Magis-Rodriguez, C. Majdan, M. Mapoma, C. C. Marcenes, W. Marzan, M. B. Masci, J. R. Mashal, M. T. Mason-Jones, A. J. Mayosi, B. M. Mazorodze, T. T. McKay, A. C. Meaney, P. A. Mehndiratta, M. M. Mejia-Rodriguez, F. Melaku, Y. A. Memish, Z. A. Mendoza, W. Miller, T. R. Mills, E. J. Mohammad, K. A. Mokdad, A. H. Mola, G. L. Monasta, L. Montico, M. Moore, A. R. Mori, R. Moturi, W. N. Mukaigawara, M. Murthy, K. S. Naheed, A. Naidoo, K. S. Naldi, L. Nangia, V. Narayan, K. M. Nash, D. Nejjari, C. Nelson, R. G. Neupane, S. P. Newton, C. R. Ng, M. Nisar, M. I. Nolte, S. Norheim, O. F. Nowaseb, V. Nyakarahuka, L. Oh, I. H. Ohkubo, T. Olusanya, B. O. Omer, S. B. Opio, J. N. Orisakwe, O. E. Pandian, J. D. Papachristou, C. Caicedo, A. J. Patten, S. B. Paul, V. K. Pavlin, B. I. Pearce, N. Pereira, D. M. Pervaiz, A. Pesudovs, K. Petzold, M. Pourmalek, F. Qato, D. Quezada, A. D. Quistberg, D. A. Rafay, A. Rahimi, K. Rahimi-Movaghar, V. Ur Rahman, S. Raju, M. Rana, S. M. Razavi, H. Reilly, R. Q. Remuzzi, G. Richardus, J. H. Ronfani, L. Roy, N. Sabin, N. Saeedi, M. Y. Sahraian, M. A. Samonte, G. M. Sawhney, M. Schneider, I. J. Schwebel, D. C. Seedat, S. Sepanlou, S. G. Servan-Mori, E. E. Sheikhbahaei, S. Shibuya, K. Shin, H. H. Shiue, I. Shivakoti, R. Sigfusdottir, I. D. Silberberg, D. H. Silva, A. P. Simard, E. P. Singh, J. A. Skirbekk, V. Sliwa, K. Soneji, S. Soshnikov, S. S. Sreeramareddy, C. T. Stathopoulou, V. K. Stroumpoulis, K. Swaminathan, S. Sykes, B. L. Tabb, K. M. Talongwa, R. T. Tenkorang, E. Y. Terkawi, A. S. Thomson, A. J. Thorne-Lyman, A. L. Towbin, J. A. Traebert, J. Tran, B. X. Dimbuene, Z. T. Tsilimbaris, M. Uchendu, U. S. Ukwaja, K. N. Uzun, S. B. Vallely, A. J. Vasankari, T. J. Venketasubramanian, N. Violante, F. S. Vlassov, V. V. Vollset, S. E. Waller, S. Wallin, M. T. Wang, L. Wang, X. Wang, Y. Weichenthal, S. Weiderpass, E. Weintraub, R. G. Westerman, R. White, R. A. Wilkinson, J. D. Williams, T. N. Woldeyohannes, S. M. Wong, J. Q. Xu, G. Yang, Y. C. Yano, Y. Yentur, G. K. Yip, P. Yonemoto, N. Yoon, S. J. Younis, M. Yu, C. Jin, K. Y. El Sayed Zaki, M. Zhao, Y. Zheng, Y. Zhou, M. Zhu, J. Zou, X. N. Lopez, A. D. Vos, T.
Lancet, (2014). 384:1005-70

Carriage of Staphylococcus aureus in Thika Level 5 Hospital, Kenya: a cross-sectional study.Aiken, A. M. Mutuku, I. M. Sabat, A. J. Akkerboom, V. Mwangi, J. Scott, J. A. Morpeth, S. C. Friedrich, A. W. Grundmann, H.
Antimicrob Resist Infect Control, (2014). 3:22

The association between age and the development of respiratory syncytial virus neutralising antibody responses following natural infection in infants.Sande, C. J. Cane, P. A. Nokes, D. J.
Vaccine, (2014). 32:4726-9

Antibiotic resistance needs global solutions.Aiken, A. M. Allegranzi, B. Scott, J. A. Mehtar, S. Pittet, D. Grundmann, H.
Lancet Infect Dis, (2014). 14:550-1

Rapid spread and diversification of respiratory syncytial virus genotype ON1, Kenya.Agoti, C. N. Otieno, J. R. Gitahi, C. W. Cane, P. A. Nokes, D. J.
Emerg Infect Dis, (2014). 20:950-9

A micro-epidemiological analysis of febrile malaria in Coastal Kenya showing hotspots within hotspots.Bejon, P. Williams, T. N. Nyundo, C. Hay, S. I. Benz, D. Gething, P. W. Otiende, M. Peshu, J. Bashraheil, M. Greenhouse, B. Bousema, T. Bauni, E. Marsh, K. Smith, D. L. Borrmann, S.
Elife, (2014). 3:e02130

Burden of disease in adults admitted to hospital in a rural region of coastal Kenya: an analysis of data from linked clinical and demographic surveillance systems.Etyang, A. O. Munge, K. Bunyasi, E. W. Matata, L. Ndila, C. Kapesa, S. Owiti, M. Khandwalla, I. Brent, A. J. Tsofa, B. Kabibu, P. Morpeth, S. Bauni, E. Otiende, M. Ojal, J. Ayieko, P. Knoll, M. D. Smeeth, L. Williams, T. N. Griffiths, U. K. Scott, J. A.
Lancet Glob Health, (2014). 2:e216-24

Phase II trial of standard versus increased transfusion volume in Ugandan children with acute severe anemia.Olupot-Olupot, P. Engoru, C. Thompson, J. Nteziyaremye, J. Chebet, M. Ssenyondo, T. Dambisya, C. M. Okuuny, V. Wokulira, R. Amorut, D. Ongodia, P. Mpoya, A. Williams, T. N. Uyoga, S. Macharia, A. Gibb, D. M. Walker, A. S. Maitland, K.
BMC Med, (2014). 12:67

Verbal autopsy as a tool for identifying children dying of sickle cell disease: a validation study conducted in Kilifi district, Kenya.Ndila, C. Bauni, E. Nyirongo, V. Mochamah, G. Makazi, A. Kosgei, P. Nyutu, G. Macharia, A. Kapesa, S. Byass, P. Williams, T. N.
BMC Med, (2014). 12:65

Global migration and the changing distribution of sickle haemoglobin: a quantitative study of temporal trends between 1960 and 2000.Piel, F. B. Tatem, A. J. Huang, Z. Gupta, S. Williams, T. N. Weatherall, D. J.
Lancet Glob Health, (2014). 2:e80-9

Examining strain diversity and phylogeography in relation to an unusual epidemic pattern of respiratory syncytial virus (RSV) in a long-term refugee camp in Kenya.Agoti, C. N. Mayieka, L. M. Otieno, J. R. Ahmed, J. A. Fields, B. S. Waiboci, L. W. Nyoka, R. Eidex, R. B. Marano, N. Burton, W. Montgomery, J. M. Breiman, R. F. Nokes, D. J.
BMC Infect Dis, (2014). 14:178

Spleen volume and clinical disease manifestations of severe Plasmodium falciparum malaria in African children.Kotlyar, S. Nteziyaremye, J. Olupot-Olupot, P. Akech, S. O. Moore, C. L. Maitland, K.
Trans R Soc Trop Med Hyg, (2014). 108:283-9