Publications

Epidemiology and Demography

Global, regional, and national incidence and mortality for HIV, tuberculosis, and malaria during 1990-2013: a systematic analysis for the Global Burden of Disease Study 2013.Murray, C. J. Ortblad, K. F. Guinovart, C. Lim, S. S. Wolock, T. M. Roberts, D. A. Dansereau, E. A. Graetz, N. Barber, R. M. Brown, J. C. Wang, H. Duber, H. C. Naghavi, M. Dicker, D. Dandona, L. Salomon, J. A. Heuton, K. R. Foreman, K. Phillips, D. E. Fleming, T. D. Flaxman, A. D. Phillips, B. K. Johnson, E. K. Coggeshall, M. S. Abd-Allah, F. Abera, S. F. Abraham, J. P. Abubakar, I. Abu-Raddad, L. J. Abu-Rmeileh, N. M. Achoki, T. Adeyemo, A. O. Adou, A. K. Adsuar, J. C. Agardh, E. E. Akena, D. Al Kahbouri, M. J. Alasfoor, D. Albittar, M. I. Alcala-Cerra, G. Alegretti, M. A. Alemu, Z. A. Alfonso-Cristancho, R. Alhabib, S. Ali, R. Alla, F. Allen, P. J. Alsharif, U. Alvarez, E. Alvis-Guzman, N. Amankwaa, A. A. Amare, A. T. Amini, H. Ammar, W. Anderson, B. O. Antonio, C. A. Anwari, P. Arnlov, J. Arsenijevic, V. S. Artaman, A. Asghar, R. J. Assadi, R. Atkins, L. S. Badawi, A. Balakrishnan, K. Banerjee, A. Basu, S. Beardsley, J. Bekele, T. Bell, M. L. Bernabe, E. Beyene, T. J. Bhala, N. Bhalla, A. Bhutta, Z. A. Abdulhak, A. B. Binagwaho, A. Blore, J. D. Basara, B. B. Bose, D. Brainin, M. Breitborde, N. Castaneda-Orjuela, C. A. Catala-Lopez, F. Chadha, V. K. Chang, J. C. Chiang, P. P. Chuang, T. W. Colomar, M. Cooper, L. T. Cooper, C. Courville, K. J. Cowie, B. C. Criqui, M. H. Dandona, R. Dayama, A. De Leo, D. Degenhardt, L. Del Pozo-Cruz, B. Deribe, K. Des Jarlais, D. C. Dessalegn, M. Dharmaratne, S. D. Dilmen, U. Ding, E. L. Driscoll, T. R. Durrani, A. M. Ellenbogen, R. G. Ermakov, S. P. Esteghamati, A. Faraon, E. J. Farzadfar, F. Fereshtehnejad, S. M. Fijabi, D. O. Forouzanfar, M. H. Fra Paleo, U. Gaffikin, L. Gamkrelidze, A. Gankpe, F. G. Geleijnse, J. M. Gessner, B. D. Gibney, K. B. Ginawi, I. A. Glaser, E. L. Gona, P. Goto, A. Gouda, H. N. Gugnani, H. C. Gupta, R. Gupta, R. Hafezi-Nejad, N. Hamadeh, R. R. Hammami, M. Hankey, G. J. Harb, H. L. Haro, J. M. Havmoeller, R. Hay, S. I. Hedayati, M. T. Pi, I. B. Hoek, H. W. Hornberger, J. C. Hosgood, H. D. Hotez, P. J. Hoy, D. G. Huang, J. J. Iburg, K. M. Idrisov, B. T. Innos, K. Jacobsen, K. H. Jeemon, P. Jensen, P. N. Jha, V. Jiang, G. Jonas, J. B. Juel, K. Kan, H. Kankindi, I. Karam, N. E. Karch, A. Karema, C. K. Kaul, A. Kawakami, N. Kazi, D. S. Kemp, A. H. Kengne, A. P. Keren, A. Kereselidze, M. Khader, Y. S. Khalifa, S. E. Khan, E. A. Khang, Y. H. Khonelidze, I. Kinfu, Y. Kinge, J. M. Knibbs, L. Kokubo, Y. Kosen, S. Defo, B. K. Kulkarni, V. S. Kulkarni, C. Kumar, K. Kumar, R. B. Kumar, G. A. Kwan, G. F. Lai, T. Balaji, A. L. Lam, H. Lan, Q. Lansingh, V. C. Larson, H. J. Larsson, A. Lee, J. T. Leigh, J. Leinsalu, M. Leung, R. Li, Y. Li, Y. De Lima, G. M. Lin, H. H. Lipshultz, S. E. Liu, S. Liu, Y. Lloyd, B. K. Lotufo, P. A. Machado, V. M. Maclachlan, J. H. Magis-Rodriguez, C. Majdan, M. Mapoma, C. C. Marcenes, W. Marzan, M. B. Masci, J. R. Mashal, M. T. Mason-Jones, A. J. Mayosi, B. M. Mazorodze, T. T. McKay, A. C. Meaney, P. A. Mehndiratta, M. M. Mejia-Rodriguez, F. Melaku, Y. A. Memish, Z. A. Mendoza, W. Miller, T. R. Mills, E. J. Mohammad, K. A. Mokdad, A. H. Mola, G. L. Monasta, L. Montico, M. Moore, A. R. Mori, R. Moturi, W. N. Mukaigawara, M. Murthy, K. S. Naheed, A. Naidoo, K. S. Naldi, L. Nangia, V. Narayan, K. M. Nash, D. Nejjari, C. Nelson, R. G. Neupane, S. P. Newton, C. R. Ng, M. Nisar, M. I. Nolte, S. Norheim, O. F. Nowaseb, V. Nyakarahuka, L. Oh, I. H. Ohkubo, T. Olusanya, B. O. Omer, S. B. Opio, J. N. Orisakwe, O. E. Pandian, J. D. Papachristou, C. Caicedo, A. J. Patten, S. B. Paul, V. K. Pavlin, B. I. Pearce, N. Pereira, D. M. Pervaiz, A. Pesudovs, K. Petzold, M. Pourmalek, F. Qato, D. Quezada, A. D. Quistberg, D. A. Rafay, A. Rahimi, K. Rahimi-Movaghar, V. Ur Rahman, S. Raju, M. Rana, S. M. Razavi, H. Reilly, R. Q. Remuzzi, G. Richardus, J. H. Ronfani, L. Roy, N. Sabin, N. Saeedi, M. Y. Sahraian, M. A. Samonte, G. M. Sawhney, M. Schneider, I. J. Schwebel, D. C. Seedat, S. Sepanlou, S. G. Servan-Mori, E. E. Sheikhbahaei, S. Shibuya, K. Shin, H. H. Shiue, I. Shivakoti, R. Sigfusdottir, I. D. Silberberg, D. H. Silva, A. P. Simard, E. P. Singh, J. A. Skirbekk, V. Sliwa, K. Soneji, S. Soshnikov, S. S. Sreeramareddy, C. T. Stathopoulou, V. K. Stroumpoulis, K. Swaminathan, S. Sykes, B. L. Tabb, K. M. Talongwa, R. T. Tenkorang, E. Y. Terkawi, A. S. Thomson, A. J. Thorne-Lyman, A. L. Towbin, J. A. Traebert, J. Tran, B. X. Dimbuene, Z. T. Tsilimbaris, M. Uchendu, U. S. Ukwaja, K. N. Uzun, S. B. Vallely, A. J. Vasankari, T. J. Venketasubramanian, N. Violante, F. S. Vlassov, V. V. Vollset, S. E. Waller, S. Wallin, M. T. Wang, L. Wang, X. Wang, Y. Weichenthal, S. Weiderpass, E. Weintraub, R. G. Westerman, R. White, R. A. Wilkinson, J. D. Williams, T. N. Woldeyohannes, S. M. Wong, J. Q. Xu, G. Yang, Y. C. Yano, Y. Yentur, G. K. Yip, P. Yonemoto, N. Yoon, S. J. Younis, M. Yu, C. Jin, K. Y. El Sayed Zaki, M. Zhao, Y. Zheng, Y. Zhou, M. Zhu, J. Zou, X. N. Lopez, A. D. Vos, T.
Lancet, (2014). 384:1005-70

Carriage of Staphylococcus aureus in Thika Level 5 Hospital, Kenya: a cross-sectional study.Aiken, A. M. Mutuku, I. M. Sabat, A. J. Akkerboom, V. Mwangi, J. Scott, J. A. Morpeth, S. C. Friedrich, A. W. Grundmann, H.
Antimicrob Resist Infect Control, (2014). 3:22

The association between age and the development of respiratory syncytial virus neutralising antibody responses following natural infection in infants.Sande, C. J. Cane, P. A. Nokes, D. J.
Vaccine, (2014). 32:4726-9

Antibiotic resistance needs global solutions.Aiken, A. M. Allegranzi, B. Scott, J. A. Mehtar, S. Pittet, D. Grundmann, H.
Lancet Infect Dis, (2014). 14:550-1

Rapid spread and diversification of respiratory syncytial virus genotype ON1, Kenya.Agoti, C. N. Otieno, J. R. Gitahi, C. W. Cane, P. A. Nokes, D. J.
Emerg Infect Dis, (2014). 20:950-9

A micro-epidemiological analysis of febrile malaria in Coastal Kenya showing hotspots within hotspots.Bejon, P. Williams, T. N. Nyundo, C. Hay, S. I. Benz, D. Gething, P. W. Otiende, M. Peshu, J. Bashraheil, M. Greenhouse, B. Bousema, T. Bauni, E. Marsh, K. Smith, D. L. Borrmann, S.
Elife, (2014). 3:e02130

Burden of disease in adults admitted to hospital in a rural region of coastal Kenya: an analysis of data from linked clinical and demographic surveillance systems.Etyang, A. O. Munge, K. Bunyasi, E. W. Matata, L. Ndila, C. Kapesa, S. Owiti, M. Khandwalla, I. Brent, A. J. Tsofa, B. Kabibu, P. Morpeth, S. Bauni, E. Otiende, M. Ojal, J. Ayieko, P. Knoll, M. D. Smeeth, L. Williams, T. N. Griffiths, U. K. Scott, J. A.
Lancet Glob Health, (2014). 2:e216-24

Phase II trial of standard versus increased transfusion volume in Ugandan children with acute severe anemia.Olupot-Olupot, P. Engoru, C. Thompson, J. Nteziyaremye, J. Chebet, M. Ssenyondo, T. Dambisya, C. M. Okuuny, V. Wokulira, R. Amorut, D. Ongodia, P. Mpoya, A. Williams, T. N. Uyoga, S. Macharia, A. Gibb, D. M. Walker, A. S. Maitland, K.
BMC Med, (2014). 12:67

Verbal autopsy as a tool for identifying children dying of sickle cell disease: a validation study conducted in Kilifi district, Kenya.Ndila, C. Bauni, E. Nyirongo, V. Mochamah, G. Makazi, A. Kosgei, P. Nyutu, G. Macharia, A. Kapesa, S. Byass, P. Williams, T. N.
BMC Med, (2014). 12:65

Global migration and the changing distribution of sickle haemoglobin: a quantitative study of temporal trends between 1960 and 2000.Piel, F. B. Tatem, A. J. Huang, Z. Gupta, S. Williams, T. N. Weatherall, D. J.
Lancet Glob Health, (2014). 2:e80-9

Examining strain diversity and phylogeography in relation to an unusual epidemic pattern of respiratory syncytial virus (RSV) in a long-term refugee camp in Kenya.Agoti, C. N. Mayieka, L. M. Otieno, J. R. Ahmed, J. A. Fields, B. S. Waiboci, L. W. Nyoka, R. Eidex, R. B. Marano, N. Burton, W. Montgomery, J. M. Breiman, R. F. Nokes, D. J.
BMC Infect Dis, (2014). 14:178

Spleen volume and clinical disease manifestations of severe Plasmodium falciparum malaria in African children.Kotlyar, S. Nteziyaremye, J. Olupot-Olupot, P. Akech, S. O. Moore, C. L. Maitland, K.
Trans R Soc Trop Med Hyg, (2014). 108:283-9

Nutritional status of young children with inherited blood disorders in western Kenya.Tsang, B. L. Sullivan, K. M. Ruth, L. J. Williams, T. N. Suchdev, P. S.
Am J Trop Med Hyg, (2014). 90:955-962

Combinatorial effects of malaria season, iron deficiency, and inflammation determine plasma hepcidin concentration in African children.Atkinson, S. H. Armitage, A. E. Khandwala, S. Mwangi, T. W. Uyoga, S. Bejon, P. A. Williams, T. N. Prentice, A. M. Drakesmith, H.
Blood, (2014). 123:3221-9

Authors' reply to Southall.Kiguli, S. Akech, S. O. Mtove, G. Opoka, R. O. Engoru, C. Olupot-Olupot, P. Nyeko, R. Evans, J. Crawley, J. Prevatt, N. Reyburn, H. Levin, M. George, E. C. South, A. Babiker, A. G. Gibb, D. M. Maitland, K.
BMJ, (2014). 348:g1619

Use of vaccines as probes to define disease burden.Feikin, D. R. Scott, J. A. Gessner, B. D.
Lancet, (2014). 383:1762-70

Epistasis between the haptoglobin common variant and alpha+thalassemia influences risk of severe malaria in Kenyan children.Atkinson, S. H. Uyoga, S. M. Nyatichi, E. Macharia, A. W. Nyutu, G. Ndila, C. Kwiatkowski, D. P. Rockett, K. A. Williams, T. N.
Blood, (2014). 123:2008-16

Immunogenicity, impact on carriage and reactogenicity of 10-valent pneumococcal non-typeable Haemophilus influenzae protein D conjugate vaccine in Kenyan children aged 1-4 years: a randomized controlled trial.Hammitt, L. L. Ojal, J. Bashraheil, M. Morpeth, S. C. Karani, A. Habib, A. Borys, D. Goldblatt, D. Scott, J. A.
PLoS One, (2014). 9:e85459

WHO guidelines on fluid resuscitation in children: missing the FEAST data.Kiguli, S. Akech, S. O. Mtove, G. Opoka, R. O. Engoru, C. Olupot-Olupot, P. Nyeko, R. Evans, J. Crawley, J. Prevatt, N. Reyburn, H. Levin, M. George, E. C. South, A. Babiker, A. G. Gibb, D. M. Maitland, K.
BMJ, (2014). 348:f7003

The source of respiratory syncytial virus infection in infants: a household cohort study in rural Kenya.Munywoki, P. K. Koech, D. C. Agoti, C. N. Lewa, C. Cane, P. A. Medley, G. F. Nokes, D. J.
J Infect Dis, (2014). 209:1685-92