Publications

Epidemiology and Demography

Case-control vaccine effectiveness studies: Data collection, analysis and reporting results.Verani, J. R. Baqui, A. H. Broome, C. V. Cherian, T. Cohen, C. Farrar, J. L. Feikin, D. R. Groome, M. J. Hajjeh, R. A. Johnson, H. L. Madhi, S. A. Mulholland, K. O'Brien, K. L. Parashar, U. D. Patel, M. M. Rodrigues, L. C. Santosham, M. Scott, J. A. Smith, P. G. Sommerfelt, H. Tate, J. E. Victor, J. C. Whitney, C. G. Zaidi, A. K. Zell, E. R.
Vaccine, (2017). 35:3303-3308

Blood Pressure and Arterial Stiffness in Kenyan Adolescents With alpha(+)Thalassemia.Etyang, A. O. Khayeka-Wandabwa, C. Kapesa, S. Muthumbi, E. Odipo, E. Wamukoya, M. Ngomi, N. Haregu, T. Kyobutungi, C. Tendwa, M. Makale, J. Macharia, A. Cruickshank, J. K. Smeeth, L. Scott, J. A. Williams, T. N.
J Am Heart Assoc, (2017). 6:

High Frequency of Blackwater Fever Among Children Presenting to Hospital With Severe Febrile Illnesses in Eastern Uganda.Olupot-Olupot, P. Engoru, C. Uyoga, S. Muhindo, R. Macharia, A. Kiguli, S. Opoka, R. O. Akech, S. Ndila, C. Nyeko, R. Mtove, G. Nteziyaremye, J. Chebet, M. George, E. C. Babiker, A. G. Gibb, D. M. Williams, T. N. Maitland, K.
Clin Infect Dis, (2017). 64:939-946

Human genetic and metabolite variation reveals that methylthioadenosine is a prognostic biomarker and an inflammatory regulator in sepsis.Wang, L. Ko, E. R. Gilchrist, J. J. Pittman, K. J. Rautanen, A. Pirinen, M. Thompson, J. W. Dubois, L. G. Langley, R. J. Jaslow, S. L. Salinas, R. E. Rouse, D. C. Moseley, M. A. Mwarumba, S. Njuguna, P. Mturi, N. Wellcome Trust Case Control, Consortium Kenyan Bacteraemia Study, Group Williams, T. N. Scott, J. A. Hill, A. V. Woods, C. W. Ginsburg, G. S. Tsalik, E. L. Ko, D. C.
Sci Adv, (2017). 3:e1602096

Mortality after Inpatient Treatment for Severe Pneumonia in Children: a Cohort Study.Ngari, M. M. Fegan, G. Mwangome, M. K. Ngama, M. J. Mturi, N. Scott, J. A. G. Bauni, E. Nokes, D. J. Berkley, J. A.
Paediatr Perinat Epidemiol, (2017). 31:233-242

Recent sequence variation in probe binding site affected detection of respiratory syncytial virus group B by real-time RT-PCR.Kamau, E. Agoti, C. N. Lewa, C. S. Oketch, J. Owor, B. E. Otieno, G. P. Bett, A. Cane, P. A. Nokes, D. J.
J Clin Virol, (2017). 88:21-25

Spread and Evolution of Respiratory Syncytial Virus A Genotype ON1, Coastal Kenya, 2010-2015.Otieno, J. R. Kamau, E. M. Agoti, C. N. Lewa, C. Otieno, G. Bett, A. Ngama, M. Cane, P. A. Nokes, D. J.
Emerg Infect Dis, (2017). 23:264-271

Characterisation of the opposing effects of G6PD deficiency on cerebral malaria and severe malarial anaemia.Clarke, G. M. Rockett, K. Kivinen, K. Hubbart, C. Jeffreys, A. E. Rowlands, K. Jallow, M. Conway, D. J. Bojang, K. A. Pinder, M. Usen, S. Sisay-Joof, F. Sirugo, G. Toure, O. Thera, M. A. Konate, S. Sissoko, S. Niangaly, A. Poudiougou, B. Mangano, V. D. Bougouma, E. C. Sirima, S. B. Modiano, D. Amenga-Etego, L. N. Ghansah, A. Koram, K. A. Wilson, M. D. Enimil, A. Evans, J. Amodu, O. K. Olaniyan, S. Apinjoh, T. Mugri, R. Ndi, A. Ndila, C. M. Uyoga, S. Macharia, A. Peshu, N. Williams, T. N. Manjurano, A. Sepulveda, N. Clark, T. G. Riley, E. Drakeley, C. Reyburn, H. Nyirongo, V. Kachala, D. Molyneux, M. Dunstan, S. J. Phu, N. H. Quyen, N. N. Thai, C. Q. Hien, T. T. Manning, L. Laman, M. Siba, P. Karunajeewa, H. Allen, S. Allen, A. Davis, T. M. Michon, P. Mueller, I. Molloy, S. F. Campino, S. Kerasidou, A. Cornelius, V. J. Hart, L. Shah, S. S. Band, G. Spencer, C. C. Agbenyega, T. Achidi, E. Doumbo, O. K. Farrar, J. Marsh, K. Taylor, T. Kwiatkowski, D. P. Malaria, G. E. N. Consortium
Elife, (2017). 6:

Predicting the relative impacts of maternal and neonatal respiratory syncytial virus (RSV) vaccine target product profiles: A consensus modelling approach.Pan-Ngum, W. Kinyanjui, T. Kiti, M. Taylor, S. Toussaint, J. F. Saralamba, S. Van Effelterre, T. Nokes, D. J. White, L. J.
Vaccine, (2017). 35:403-409

Differing rates of antibody acquisition to merozoite antigens in malaria: implications for immunity and surveillance.McCallum, F. J. Persson, K. E. Fowkes, F. J. Reiling, L. Mugyenyi, C. K. Richards, J. S. Simpson, J. A. Williams, T. N. Gilson, P. R. Hodder, A. N. Sanders, P. R. Anders, R. F. Narum, D. L. Chitnis, C. Crabb, B. S. Marsh, K. Beeson, J. G.
J Leukoc Biol, (2017). 101:913-925

Cohort Profile: The Kilifi Vaccine Monitoring Study.Adetifa, I. M. O. Bwanaali, T. Wafula, J. Mutuku, A. Karia, B. Makumi, A. Mwatsuma, P. Bauni, E. Hammitt, L. L. Nokes, D. J. Maree, E. Tabu, C. Kamau, T. Mataza, C. Williams, T. N. Scott, J. A. G.
Int J Epidemiol, (2017). 46:792-792h

Linking health facility data from young adults aged 18-24 years to longitudinal demographic data: Experience from The Kilifi Health and Demographic Surveillance System [version 1; referees: 1 approved, 1 approved with reservations].Nyundo, C Doyle, AM Walumbe, D Otiende, M Kinuthia, M Amadi, D Jibendi, B Mochamah, G Kihuha, N Williams, TN Ross, DA Bauni, E
Wellcome Open Res, (2017). 2:

Quantification and determinants of the amount of respiratory syncytial virus (RSV) shed using real time PCR data from a longitudinal household study.Wathuo, M. Medley, G. F. Nokes, D. J. Munywoki, P. K.
Wellcome Open Res, (2016). 1:27

Clinical and Epidemiological Implications of 24-Hour Ambulatory Blood Pressure Monitoring for the Diagnosis of Hypertension in Kenyan Adults: A Population-Based Study.Etyang, A. O. Warne, B. Kapesa, S. Munge, K. Bauni, E. Cruickshank, J. K. Smeeth, L. Scott, J. A.
J Am Heart Assoc, (2016). 5:

Absence of Association between Cord Specific Antibody Levels and Severe Respiratory Syncytial Virus (RSV) Disease in Early Infants: A Case Control Study from Coastal Kenya.Nyiro, J. U. Sande, C. J. Mutunga, M. Kiyuka, P. K. Munywoki, P. K. Scott, J. A. Nokes, D. J.
PLoS One, (2016). 11:e0166706

Pertussis-Associated Pneumonia in Infants and Children From Low- and Middle-Income Countries Participating in the PERCH Study.Barger-Kamate, B. Deloria Knoll, M. Kagucia, E. W. Prosperi, C. Baggett, H. C. Brooks, W. A. Feikin, D. R. Hammitt, L. L. Howie, S. R. Levine, O. S. Madhi, S. A. Scott, J. A. Thea, D. M. Amornintapichet, T. Anderson, T. P. Awori, J. O. Baillie, V. L. Chipeta, J. DeLuca, A. N. Driscoll, A. J. Goswami, D. Higdon, M. M. Hossain, L. Karron, R. A. Maloney, S. Moore, D. P. Morpeth, S. C. Mwananyanda, L. Ofordile, O. Olutunde, E. Park, D. E. Sow, S. O. Tapia, M. D. Murdoch, D. R. O'Brien, K. L. Kotloff, K. L. Pneumonia Etiology Research for Child Health Study, Group
Clin Infect Dis, (2016). 63:S187-S196

Validation of triple pass 24-hour dietary recall in Ugandan children by simultaneous weighed food assessment.Nightingale, H. Walsh, K. J. Olupot-Olupot, P. Engoru, C. Ssenyondo, T. Nteziyaremye, J. Amorut, D. Nakuya, M. Arimi, M. Frost, G. Maitland, K.
BMC Nutr, (2016). 2:

Quantifying social contacts in a household setting of rural Kenya using wearable proximity sensors.Kiti, M. C. Tizzoni, M. Kinyanjui, T. M. Koech, D. C. Munywoki, P. K. Meriac, M. Cappa, L. Panisson, A. Barrat, A. Cattuto, C. Nokes, D. J.
EPJ Data Sci, (2016). 5:21

Human Rhinovirus B and C Genomes from Rural Coastal Kenya.Agoti, C. N. Kiyuka, P. K. Kamau, E. Munywoki, P. K. Bett, A. van der Hoek, L. Kellam, P. Nokes, D. J. Cotten, M.
Genome Announc, (2016). 4:

Age, Spatial, and Temporal Variations in Hospital Admissions with Malaria in Kilifi County, Kenya: A 25-Year Longitudinal Observational Study.Mogeni, P. Williams, T. N. Fegan, G. Nyundo, C. Bauni, E. Mwai, K. Omedo, I. Njuguna, P. Newton, C. R. Osier, F. Berkley, J. A. Hammitt, L. L. Lowe, B. Mwambingu, G. Awuondo, K. Mturi, N. Peshu, N. Snow, R. W. Noor, A. Marsh, K. Bejon, P.
PLoS Med, (2016). 13:e1002047